Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  47  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11380184--11380229
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25
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0
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7
48
22
1.75
11380631--11380729
30
3.3
30
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0
171
18
6
49
26
1.70
11381251--11381295
21
2.1
21
91
0
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28
28
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33
1.87
11381587--11381636
15
3.6
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15
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18
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2.0
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100
0
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16
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15
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69
64
2
2
31
1.16
11388605--11388651
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5.9
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60
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2
2
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23
2.0
23
82
0
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56
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32
1.60
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25
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21
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3
6
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17
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0
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2
2
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1.15
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23
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65
63
0
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32
1.14
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16
2.4
16
86
0
51
43
28
5
23
1.75
11389465--11389563
30
3.3
30
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0
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17
6
50
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17
2.6
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2
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100
0
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86
0
0
13
0.58
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3.9
38
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2
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46
4
19
29
1.70
11394327--11394476
77
1.9
78
83
1
194
46
4
19
29
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11396621--11396664
17
2.6
17
77
0
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54
2
9
34
1.44
11397441--11397599
39
4.1
39
84
2
176
28
21
5
44
1.75
11397459--11397597
39
3.6
39
86
0
181
29
16
5
48
1.69
11398817--11398926
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2.5
45
80
2
125
22
30
12
33
1.92
11399001--11400179
210
5.7
210
87
4
1540
30
22
18
28
1.97
11399001--11400179
417
2.8
412
87
4
1651
30
22
18
28
1.97
11408732--11408762
15
2.1
15
100
0
62
54
0
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6
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3.7
210
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28
18
22
30
1.97
11417429--11417514
45
1.9
45
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4
120
31
13
29
25
1.94
11418728--11418875
38
3.9
37
89
3
188
45
5
19
29
1.72
11418728--11418880
76
2.0
76
85
0
207
45
5
20
28
1.73
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2
15.5
2
100
0
62
48
0
0
51
1.00
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2.2
26
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15
64
35
5
5
54
1.46
11422648--11422697
18
2.8
19
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17
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14
14
22
1.77
11423864--11424099
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98
0
454
50
16
16
16
1.79
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23
83
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214
29
32
16
21
1.95
11427788--11427987
70
2.8
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81
6
233
30
32
16
21
1.95
11428008--11428109
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2.3
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81
1
105
24
18
24
32
1.97
11431264--11431305
22
2.0
22
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9
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57
4
7
30
1.47
11433623--11433769
44
3.4
45
69
11
135
16
23
24
35
1.95
11433581--11433818
86
2.7
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87
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331
19
23
22
34
1.96
11433579--11433859
43
6.5
45
69
15
182
19
22
22
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11446016--11446057
22
2.0
22
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30
1.47
11450886--11450921
18
2.0
18
89
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69
2
0
27
1.02
11451187--11451231
23
2.0
23
82
4
56
37
20
6
35
1.79
11451210--11451280
19
3.9
19
80
14
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33
16
11
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11451203--11451287
17
4.9
17
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22
70
34
16
10
38
1.83
11451398--11451436
20
1.9
19
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10
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10
2
15
71
1.23
11451595--11451723
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152
27
28
13
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1.94
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430
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18
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12
100
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0
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27
1
4
66
1.20
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23
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23
90
0
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0
0
73
0.84
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21
1.9
21
84
0
53
55
7
0
37
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.6
25
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9
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4
10
34
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30
2.1
29
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79
25
15
15
44
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30
2.1
30
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0
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14
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25
2.0
25
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0
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1.77
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94
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1.83
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2.0
38
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2.0
23
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1.43
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51
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18
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26
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1.78
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1.93
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0
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1.97
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0
2
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1.81
11520822--11520956
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1.81
11520822--11520956
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2.5
54
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254
37
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1.96
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17
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18
92
5
113
37
14
10
37
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11522012--11522080
35
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0
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1.11
11524695--11524742
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1.11
11524695--11524742
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25
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1.11
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1.27
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1.50
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1.9
340
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1.94
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31
1.94
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253
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2
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1.94
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13.1
7
73
19
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2
2
22
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11551445--11551487
20
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21
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1.22
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0
0
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0.58
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5
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1.22
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0
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2.0
22
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12
65
9
9
13
68
1.40

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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