Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  411  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119413689--119413772
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26
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0
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2.0
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1.9
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0
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2.3
19
84
8
52
34
25
18
20
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
45
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1.9
23
81
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54
41
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2
27
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22
2.0
22
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61
30
20
23
25
1.99
119455312--119455355
23
1.9
23
86
9
63
36
20
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18
1.95
119455258--119455353
45
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20
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25
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0
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2.7
28
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21
29
1.59
119471521--119471639
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152
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30
1.96
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2.4
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27
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119479517--119479940
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714
31
27
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33
1.85
119484171--119484337
35
4.6
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33
24
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23
11
31
1.90
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35
4.6
35
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201
33
24
10
31
1.90
119491604--119491775
75
2.4
73
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226
33
23
11
31
1.90
119499112--119499279
35
4.7
34
83
8
183
33
24
11
30
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119499109--119499279
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224
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11
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1.90
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0
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10
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119530852--119530993
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11
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12
50
35
0
0
64
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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0
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0
0
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0
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1.95
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0
1035
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1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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8
0
64
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
29
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79
5
22
1
71
1.15

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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