Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  377  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109572630--109572679
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26
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0
0
50
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2.1
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88
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20
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29
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2.0
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2
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0
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0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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2.1
30
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24
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12
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0
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26
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17
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2
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0
0
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0
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0
0
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2.0
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2.2
24
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109646589--109646747
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4
1
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1.23
109646758--109646806
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0
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52
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2.0
21
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55
45
0
2
52
1.14
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3
53
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20
1.24
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2.1
37
88
9
115
75
5
8
10
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109649847--109649982
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5.2
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23
36
1.79
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2.0
43
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10
106
26
29
20
23
1.99
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2.5
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10
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1.64
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2.0
466
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1747
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15
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30
1.93
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16
3.4
16
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51
10
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1.37
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2.4
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1.42
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16
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1.58
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25
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1.8
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0
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109691360--109691415
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0
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109691513--109691598
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19
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1.44
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2.4
24
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0
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5
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1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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2.9
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107
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10
32
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.84
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1.88
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3.8
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77
4
218
37
16
24
20
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.97
109811627--109811899
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3.2
85
80
1
303
24
17
27
30
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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