Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  436  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126290309--126290350
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0
0
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0
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0
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0
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0
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3
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7.7
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0
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2.0
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52
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4
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0
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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0
0
35
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0
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0
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2.0
42
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1.46
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109
29
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59
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100
0
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100
0
110
21
27
0
50
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126429802--126429839
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13
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13
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0
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2.5
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73
18
3
4
1.14
126430563--126430625
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2.5
26
92
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20
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71
2.0
71
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218
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15
20
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1.94
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1.59
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16
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65
0.93
126465748--126465797
24
2.1
24
85
7
66
22
22
14
42
1.88
126468638--126468903
46
6.0
45
85
8
339
21
23
15
39
1.92
126468816--126468891
38
2.0
38
100
0
152
21
26
18
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126471038--126471089
11
4.7
11
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9
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63
3
0
32
1.12
126473929--126474194
46
6.0
45
85
8
339
21
23
15
39
1.92
126474107--126474182
38
2.0
38
100
0
152
21
26
18
34
1.96
126476332--126476383
11
4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
126481675--126481708
17
1.9
18
88
5
52
44
29
20
5
1.75
126482100--126482223
61
2.0
61
96
0
230
32
16
25
25
1.96
126482168--126482310
74
1.9
75
88
2
216
30
18
22
27
1.97
126482225--126482399
91
2.0
88
84
7
228
28
18
19
33
1.96
126482314--126482749
78
5.7
75
82
7
517
32
15
19
32
1.93
126484383--126484427
11
4.1
11
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0
54
35
0
4
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1.17
126484501--126484534
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2.1
16
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52
0
0
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1.00
126487165--126487224
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7
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1
1
31
1.13
126487165--126487228
24
2.7
24
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9
87
65
1
1
31
1.11
126487378--126487442
25
2.8
24
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6
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52
6
7
33
1.55
126487458--126487535
2
41.5
2
74
16
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1
2
39
1.21
126487426--126487580
55
2.8
55
82
9
165
56
3
4
36
1.36
126487556--126487601
25
1.9
25
86
8
69
60
0
4
34
1.16
126488135--126488235
30
3.4
30
98
0
193
18
3
48
28
1.66
126489046--126489529
73
6.5
73
88
3
673
31
22
16
29
1.96
126489538--126489566
14
2.1
14
100
0
58
65
6
13
13
1.45
126489455--126489622
93
1.8
91
91
5
275
33
20
17
28
1.95
126489382--126489784
165
2.6
164
83
9
515
33
21
17
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126489084--126489926
238
3.6
233
88
4
1163
32
22
16
28
1.96
126489546--126489783
73
3.3
73
91
4
367
34
21
17
26
1.95
126489767--126489798
14
2.3
14
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0
55
65
9
12
12
1.47
126489693--126489853
87
1.9
85
85
7
227
35
21
16
26
1.95
126501801--126501847
14
3.2
15
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11
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2
2
31
1.18
126501790--126501851
22
2.7
24
82
9
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1
1
30
1.11
126501790--126501832
8
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10
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0
0
32
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2.8
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33
1.55
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25
2.4
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1
3
37
1.25
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3
5
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1.39
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0
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1.16
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1.70
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0
2
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1.15
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1.8
93
91
0
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21
21
28
28
1.98
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181
22
20
27
29
1.99
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2
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2
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3
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47
0
0
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1.00
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31
0
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19
2.0
20
89
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42
0
2
55
1.14
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20
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3
56
41
0
2
56
1.11
126554981--126555014
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10
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0
8
8
0.85
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17
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42
0
1
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1.10
126565129--126565175
15
3.1
15
87
0
67
61
2
12
23
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126569537--126569571
17
2.1
17
100
0
70
48
0
5
45
1.26
126572584--126572630
18
2.5
19
89
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69
46
17
10
25
1.79
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2.1
31
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57
10
4
26
1.52
126576268--126576310
22
2.0
22
85
0
59
55
9
13
20
1.66
126580559--126580607
18
2.6
18
87
6
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44
14
10
30
1.78
126580619--126580654
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2.2
16
100
0
72
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38
5
25
1.78
126580619--126580662
16
2.8
16
92
0
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4
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1.75
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1.76
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20
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0
2
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1.05
126601816--126601882
32
2.2
31
89
10
102
59
2
1
35
1.22

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444