Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  204  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57031356--57031453
30
3.3
30
72
4
90
27
26
16
29
1.97
57033062--57033110
10
4.8
10
80
11
55
79
4
4
12
1.01
57033061--57033113
22
2.4
22
80
0
61
81
3
3
11
0.96
57033061--57033111
11
4.8
11
80
2
52
80
3
3
11
0.98
57034014--57034081
21
3.2
20
80
12
66
76
4
17
1
1.03
57034025--57034081
5
11.0
5
77
17
55
77
3
17
1
1.00
57034025--57034081
16
3.7
14
80
17
60
77
3
17
1
1.00
57034129--57034159
12
2.6
12
94
0
53
45
9
16
29
1.79
57034162--57034186
12
2.1
12
100
0
50
76
0
16
8
1.02
57034156--57034211
18
3.1
18
76
5
51
69
3
19
7
1.27
57034162--57034243
30
2.7
31
81
5
105
64
1
21
12
1.33
57035687--57035733
18
2.6
18
96
0
85
38
10
17
34
1.84
57036474--57036571
30
3.3
30
72
4
90
27
26
16
29
1.97
57038022--57038061
19
2.1
19
90
0
62
30
35
12
22
1.91
57039267--57039314
14
3.4
14
82
0
51
18
29
6
45
1.74
57044030--57044069
19
2.1
19
85
0
53
25
35
17
22
1.95
57045642--57045689
14
3.4
14
85
0
60
43
6
31
18
1.75
57050740--57050836
30
3.2
31
74
11
103
27
27
15
28
1.96
57052659--57052687
10
2.7
11
89
10
51
72
6
0
20
1.07
57053629--57053685
11
5.5
10
73
22
55
77
0
17
5
0.95
57053629--57053685
5
11.0
5
77
20
55
77
0
17
5
0.95
57053629--57053685
16
3.7
15
86
6
78
77
0
17
5
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57053618--57053685
21
3.2
20
78
15
66
76
1
17
4
1.03
57053733--57053763
12
2.6
12
100
0
62
45
12
16
25
1.83
57053766--57053790
12
2.1
12
100
0
50
76
0
16
8
1.02
57053760--57053815
18
3.1
18
76
5
51
69
3
17
8
1.29
57053766--57053847
30
2.7
31
79
5
96
64
1
20
13
1.34
57055918--57055986
30
2.2
31
85
10
88
33
30
10
26
1.89
57057802--57057849
20
2.4
20
75
0
60
25
29
14
31
1.95
57060872--57060968
30
3.2
30
71
8
81
28
15
27
27
1.96
57060985--57061029
20
2.2
21
84
11
58
33
13
28
24
1.93
57061438--57061485
14
3.4
14
85
0
60
43
6
29
20
1.76
57063027--57063074
15
3.3
15
73
5
53
29
0
27
43
1.55
57063021--57063064
14
3.1
14
74
6
52
27
0
34
38
1.57
57063021--57063080
29
2.1
29
93
0
102
28
0
30
41
1.56
57064053--57064097
14
3.3
14
78
6
56
48
15
0
35
1.45
57067812--57067859
15
3.3
15
73
5
53
29
0
27
43
1.55
57067806--57067849
14
3.1
14
74
6
52
27
0
34
38
1.57
57067806--57067865
29
2.1
29
93
0
102
28
0
30
41
1.56
57068838--57068882
14
3.3
14
78
6
56
48
15
0
35
1.45
57071465--57071561
30
3.2
30
76
2
106
27
27
16
27
1.97
57074068--57074124
11
5.5
10
73
22
55
77
1
17
3
1.00
57074068--57074124
5
11.0
5
77
17
55
77
1
17
3
1.00
57074068--57074124
16
3.7
14
80
17
60
77
1
17
3
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57074193--57074217
12
2.1
12
100
0
50
76
0
16
8
1.02
57074187--57074229
18
2.3
18
84
4
50
69
2
18
9
1.26
57074210--57074243
12
2.8
12
95
0
59
58
0
26
14
1.36
57074228--57074287
30
2.0
31
83
9
79
58
1
25
15
1.46
57075587--57075631
14
3.3
14
78
6
56
35
0
15
48
1.45
57077817--57077866
18
2.8
18
87
0
73
58
0
28
14
1.37
57077810--57077891
24
3.4
24
79
0
92
59
0
28
12
1.33
57077886--57077922
18
2.0
19
89
5
58
67
2
21
8
1.29
57079345--57079404
29
2.1
29
87
0
84
41
26
0
31
1.56
57080501--57080545
14
3.3
14
78
6
56
35
0
15
48
1.45
57081522--57081581
29
2.1
29
90
0
93
41
31
1
25
1.65
57083061--57083105
14
3.3
14
78
6
56
35
0
15
48
1.45
57084082--57084141
29
2.1
29
87
6
86
41
30
1
26
1.65
57085626--57085670
14
3.3
14
84
6
65
37
0
13
48
1.42
57086833--57086861
11
2.5
12
88
11
51
72
10
0
17
1.11
57086836--57086888
28
1.9
28
84
3
72
79
5
1
13
0.99
57093654--57093759
42
2.5
42
98
1
203
33
12
14
40
1.83
57093742--57093786
14
3.3
14
84
6
65
37
0
13
48
1.42
57094762--57094821
29
2.1
29
90
0
93
41
31
0
26
1.56
57095036--57095070
18
2.0
17
88
5
52
74
5
5
14
1.19
57095970--57096019
18
2.8
18
87
0
73
58
0
28
14
1.37
57095963--57096044
24
3.4
24
79
0
92
59
0
28
12
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57097497--57097556
29
2.1
29
87
0
84
41
26
0
31
1.56
57098653--57098697
14
3.3
14
78
6
56
35
0
15
48
1.45
57099672--57099731
29
2.1
29
90
0
93
41
31
0
26
1.56
57101213--57101257
14
3.3
14
84
6
65
37
0
13
48
1.42
57102423--57102477
28
2.0
28
85
3
76
76
5
1
16
1.06
57106196--57106269
21
3.6
21
67
22
50
70
2
20
6
1.23
57109331--57109436
42
2.5
42
96
1
194
33
12
13
40
1.81
57109419--57109463
14
3.3
14
84
6
65
37
0
13
48
1.42
57111061--57111185
62
2.0
61
89
1
187
19
19
22
39
1.93
57113050--57113133
30
2.8
30
85
3
107
27
19
33
20
1.96
57117144--57117211
21
3.2
21
65
8
57
58
7
22
11
1.57
57117122--57117218
42
2.3
42
87
5
135
56
7
21
14
1.62
57117222--57117271
18
2.8
18
84
0
64
56
0
30
14
1.39
57117287--57117325
18
2.1
19
85
4
53
66
2
23
7
1.30
57121363--57121402
19
2.1
19
90
0
62
27
35
15
22
1.94
57123992--57124089
30
3.3
30
70
7
74
28
26
15
29
1.96
57133656--57133752
30
3.2
30
77
2
106
28
15
26
28
1.96
57134425--57134473
21
2.4
20
86
3
62
14
20
22
42
1.88
57134696--57134720
13
1.9
13
100
0
50
28
0
8
64
1.22
57136848--57136932
21
4.1
20
67
7
53
63
5
21
9
1.45
57136826--57136922
42
2.3
42
91
1
151
56
5
23
14
1.58
57138590--57138637
20
2.4
20
75
0
60
20
29
18
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57141038--57141105
21
3.2
21
65
8
57
58
7
22
11
1.57
57141016--57141112
42
2.3
42
91
1
151
56
5
23
14
1.58
57141116--57141168
18
2.9
18
74
0
61
56
0
30
13
1.37
57141107--57141178
36
2.0
36
86
0
99
63
1
25
9
1.33
57141171--57141209
18
2.1
19
85
4
53
66
2
23
7
1.30
57141876--57141910
10
3.5
10
88
0
52
40
22
22
14
1.90
57141873--57141920
20
2.4
20
71
0
51
33
18
27
20
1.96
57141902--57141950
20
2.5
20
77
16
57
30
14
36
18
1.90
57142798--57142841
23
1.9
24
90
9
74
18
0
2
79
0.83
57143188--57143243
14
4.0
14
85
0
58
39
3
32
25
1.73
57143797--57143831
17
2.1
17
100
0
70
34
5
17
42
1.73
57145691--57145735
20
2.2
20
84
0
54
17
24
20
37
1.93
57145698--57145755
10
5.8
10
75
0
53
13
22
20
43
1.87
57145707--57145755
20
2.5
20
96
0
89
12
20
22
44
1.84
57146400--57146432
12
2.8
12
86
4
50
36
3
9
51
1.49
57146770--57146861
42
2.2
41
96
3
168
28
36
13
21
1.91
57148573--57148609
11
3.4
11
88
11
58
67
8
5
18
1.36
57149524--57149580
11
5.5
10
73
22
55
77
1
17
3
1.00
57149524--57149580
5
11.0
5
77
17
55
77
1
17
3
1.00
57149524--57149580
16
3.7
14
80
17
60
77
1
17
3
1.00
57149649--57149673
12
2.1
12
100
0
50
76
0
16
8
1.02
57149643--57149698
18
3.1
18
79
5
60
69
1
19
8
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57149649--57149730
30
2.7
31
84
5
114
64
0
21
13
1.28
57151811--57151907
30
3.2
31
73
5
101
27
28
15
27
1.96
57154589--57154685
30
3.2
30
75
2
88
28
12
27
30
1.93
57156783--57156865
30
2.7
30
81
9
89
13
21
1
63
1.35
57156816--57156871
18
3.1
18
76
5
51
7
19
3
69
1.27
57156841--57156865
12
2.1
12
100
0
50
8
16
0
76
1.02
57156868--57156898
12
2.6
12
94
0
53
29
16
9
45
1.79
57156946--57157002
5
11.0
5
75
20
55
3
17
1
77
1.00
57156946--57157002
16
3.7
14
82
15
60
3
17
1
77
1.00
57156944--57157013
20
3.3
20
73
18
63
4
18
1
75
1.04

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444