Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  302  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86977229--86977261
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12
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3
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0
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2.0
20
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1.9
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0
0
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1.00
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20
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20
2.1
20
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0
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24
1.95
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23
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0
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1.9
16
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53
41
0
22
35
1.54
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21
2.0
22
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10
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18
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95
65
3
5
25
1.32
87042084--87042140
26
2.3
24
81
6
69
7
3
42
47
1.47
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44
2.2
44
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23
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5.0
143
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20
30
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1.9
65
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50
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20
20
1.76
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7
14.7
7
71
18
58
3
12
3
79
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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13
3
79
1.00
87044393--87044496
39
2.6
37
80
10
109
3
12
3
79
1.00
87048796--87048833
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2.1
18
100
0
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26.0
3
74
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87049468--87049536
9
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9
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9
63
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5
23
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3.4
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4
4
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2.0
22
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24
1.98
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28
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24
2.1
24
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57
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28
1.52
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145
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1.96
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2.0
55
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0
204
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122
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2.2
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2.0
60
100
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20
1.79
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16
29
1.94
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19
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1.98
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13.3
44
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21
230
32
17
20
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87118659--87119673
188
5.4
186
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19
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3.2
50
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19
135
32
16
22
28
1.96
87118875--87119682
94
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94
78
8
688
32
17
20
29
1.95
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2.1
23
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1.62
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23
2.2
23
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0
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0
0
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0
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2.0
26
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0
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7
22
30
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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0
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29
1.84
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21
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2.3
29
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0
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1.98
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22
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1.99
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87217919--87217975
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31
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27
28
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27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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207
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1.97
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413
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48
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0
232
34
29
16
19
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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52
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0
16
1.44

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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