Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  55  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13299217--13299297
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30
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15
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92
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17
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13313300--13313377
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79
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1.98
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232
28
29
21
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1.98
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30
23
26
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1.98
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3.0
49
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19
1.96
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20
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20
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57
48
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2.0
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19
2.1
19
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0
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5
55
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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54
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55
3.0
55
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3
266
39
17
15
27
1.90
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14
2.1
14
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63
6
13
16
1.50
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2.3
73
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201
36
19
15
28
1.92
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271
2.7
271
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1
1306
37
19
15
27
1.92
13374181--13374348
55
3.0
55
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266
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14
2.1
14
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0
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63
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16
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13
22
1.56
13374413--13374448
14
2.5
15
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8
58
58
5
13
22
1.56
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1.94
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2.4
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1
31
1.19
13395758--13395823
30
2.2
30
82
15
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1.45
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9
12.3
9
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59
56
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1.31
13395920--13395994
20
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20
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2
35
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61
2
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1.28
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3
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57
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2
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2.3
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2.3
21
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10
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58
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1
35
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13407292--13407346
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2.1
26
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5
30
1.15
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3
13.7
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2
2
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1.21
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17
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1.50
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66
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227
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0
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31
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2.5
19
84
9
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32
6
6
56
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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15
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1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
1
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1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13570887--13570928
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19
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50
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0
0
76
0.78

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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