Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  205  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57157253--57157300
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15
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0
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0
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1.57
57157247--57157306
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0
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1.56
57158287--57158331
14
3.3
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2
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27
29
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2.00
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0
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2.7
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100
0
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11
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17
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57208427--57208658
100
2.3
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2
320
29
27
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1.98
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24
2.2
24
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1.84
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3.0
19
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2
98
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15
29
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1.96
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2.4
54
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5
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34
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23
1.94
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176
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9
19
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1.83
57215892--57216146
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4.8
54
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3
309
30
8
20
40
1.82
57215900--57216146
80
3.1
80
84
2
325
30
8
20
40
1.83
57215900--57216146
27
9.2
27
85
1
282
30
8
20
40
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57215861--57216147
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107
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30
9
20
40
1.83
57221686--57221782
30
3.2
30
71
8
90
27
15
28
27
1.96
57225490--57225572
30
2.7
30
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9
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20
1
63
1.36
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18
2.9
18
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2
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18
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67
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0
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100
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5
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5
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17
1
77
1.00
57225653--57225709
16
3.7
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82
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60
3
17
1
77
1.00
57225651--57225720
20
3.3
20
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2
18
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57228251--57228347
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3.2
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27
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2
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0
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12
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29
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30
0
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1.56
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78
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48
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14
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65
37
0
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48
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57243828--57243887
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29
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3.3
15
73
5
53
43
27
0
29
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57244101--57244149
11
4.5
11
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12
1.07
57244104--57244142
10
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10
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1.00
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3.6
21
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1
20
8
1.20
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14
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13
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1.42
57250534--57250593
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2.1
29
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28
0
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1.56
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43
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0
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1.55
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28
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20
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1.25
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3.6
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6
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0
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14
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0
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60
20
14
5
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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275
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1.98
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0
0
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1.00
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22
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24
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1
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1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
22
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0
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14
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2.0
21
85
4
57
59
4
2
33
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
19
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5
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1.37
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1.92
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1.97
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16
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8
19
0
71
1.11

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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