Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  26  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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6697996--6698222
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2.7
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366
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430
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18
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188
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493
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18
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1.32
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14
2.9
15
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6
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51
37
0
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1.39
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27
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1
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0
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32
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30
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6749161--6749203
22
2.0
22
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4
79
32
0
2
65
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
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0
0
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17
100
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0
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1.9
19
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13.2
26
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0
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1.21
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26
5
0
67
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6784678--6784751
28
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29
6
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60
1.36
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1.9
28
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3
90
30
11
0
58
1.33
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21
2.6
20
75
6
61
28
3
3
63
1.30
6785180--6785250
19
3.9
18
80
15
76
35
11
16
36
1.85
6785179--6785292
18
6.3
18
85
5
151
36
11
14
36
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6785187--6785291
35
3.0
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94
1
174
37
12
14
36
1.84
6785187--6785291
17
5.9
17
86
6
138
37
12
14
36
1.84
6785753--6785818
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3.9
17
71
23
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1
0
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0
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1.08
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2.0
20
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0
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12
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8.6
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12
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0.85
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4.7
14
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75
83
1
12
3
0.83
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119
94
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1916
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16
20
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1.95
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18
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19
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10
16
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1.82
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18
9.5
15
70
23
90
39
9
13
37
1.77
6794495--6794682
35
5.3
35
92
1
295
39
10
13
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1.78
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17
3.9
17
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23
59
34
1
0
63
1.04
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1.9
25
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0
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19
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1
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0
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8.5
6
76
15
54
20
1
3
73
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6802091--6802238
43
3.5
42
85
3
197
22
22
28
26
1.99
6803735--6803819
24
3.5
24
91
3
127
29
22
17
30
1.97
6803781--6803843
24
2.6
24
97
0
117
34
25
17
22
1.95
6805995--6806027
2
16.5
2
100
0
66
48
0
0
51
1.00
6810718--6810806
44
2.0
44
84
8
117
43
2
7
46
1.45
6828541--6828590
26
1.9
26
87
0
73
60
2
6
32
1.32
6828575--6828625
22
2.3
22
83
6
59
66
1
5
25
1.24
6828597--6828651
27
2.1
26
86
6
76
63
5
5
25
1.38
6828711--6828764
26
2.0
27
82
10
67
57
0
5
37
1.22
6828723--6828769
23
2.1
22
84
11
60
61
0
6
31
1.21
6832642--6833463
141
5.9
140
87
2
1020
27
15
23
33
1.95
6833589--6833664
7
11.3
7
77
8
86
14
0
44
40
1.45
6834646--6834750
35
3.0
35
84
0
138
16
39
20
24
1.92
6840859--6840933
37
2.0
37
100
0
150
40
2
21
36
1.67
6844452--6844504
18
2.8
18
85
5
52
11
20
11
56
1.65
6844461--6844504
18
2.4
18
88
3
61
9
20
13
56
1.64
6847758--6847844
45
1.9
45
88
0
129
31
10
19
39
1.85
6848198--6848596
73
5.5
73
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3
408
27
20
15
36
1.93
6848131--6848655
147
3.6
145
79
7
460
27
20
15
37
1.92
6848199--6848596
220
1.8
219
83
1
528
27
20
15
36
1.93
6848316--6848600
36
7.8
36
78
11
204
27
21
15
35
1.93
6854970--6855025
25
2.2
25
96
0
103
41
10
5
42
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6859400--6859438
19
2.1
19
95
0
69
41
10
0
48
1.37
6861777--6861821
2
22.5
2
100
0
90
51
0
0
48
1.00
6864489--6864530
3
14.0
3
90
9
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64
33
2
0
1.07
6864787--6864906
3
40.7
3
69
9
68
56
3
9
30
1.47
6866633--6867140
44
11.5
43
69
10
197
27
22
19
29
1.98
6866630--6867155
133
4.0
133
89
1
725
28
22
19
30
1.98
6866717--6867099
89
4.3
89
72
8
312
28
23
18
30
1.97
6867109--6867579
88
5.4
89
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4
449
28
21
22
27
1.99
6867180--6867579
176
2.3
175
89
3
590
28
21
23
27
1.99
6867601--6867713
44
2.6
43
81
4
138
26
18
22
32
1.97
6867675--6867902
88
2.6
88
85
1
287
25
20
19
35
1.96
6867875--6868151
131
2.1
131
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0
455
27
20
22
29
1.99
6867858--6868106
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5.7
43
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4
142
26
21
22
29
1.99
6868221--6868348
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2.0
64
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0
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14
18
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4.8
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10
19
19
1.77
6872693--6872738
19
2.4
19
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7
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50
10
19
19
1.77
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3
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128
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2
7
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1.36
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2.5
23
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10
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27
6
1
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16
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5
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54
0
0
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0
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1.16
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1.9
18
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11
2
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1.50
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8
3.4
8
100
0
54
88
0
11
0
0.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6889022--6889063
10
4.1
10
84
3
57
21
4
2
71
1.16
6889022--6889061
20
2.0
20
95
0
71
20
5
2
72
1.15
6891801--6892004
102
2.0
102
95
0
365
42
19
10
27
1.84
6899113--6899144
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2.1
15
100
0
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1.67
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2.3
32
100
0
148
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21
9
20
1.77
6902586--6902661
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2.5
30
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14
22
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1.93
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0
1
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9
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0
1
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0
2
66
1.05
6907639--6907694
21
2.6
21
81
18
71
32
0
1
66
1.03

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444