Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  124  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
32106581--32106719
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3.6
39
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0
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0
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2.2
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22
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2.0
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4.8
45
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28
18
28
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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6
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23
2.0
26
84
11
68
38
14
6
40
1.71
32225970--32226046
11
6.9
11
69
24
54
55
2
1
40
1.22
32237985--32238018
17
1.9
18
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20
2
2
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1.09
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2.0
20
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26
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2.0
20
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0
2
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1.16
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2.0
25
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0
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45
0
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1.54
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9
5.1
9
94
0
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45
1.79
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100
0
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1.86
32268576--32268622
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4.1
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1.65
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2.2
25
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2.3
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25
15
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53
1.62
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2.2
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2.1
73
97
0
286
28
32
10
28
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
32286649--32286892
122
2.0
122
97
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461
28
31
10
29
1.90
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49
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30
31
9
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1.88
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14
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35
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30
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1.55
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19
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49
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4
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27
19
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28
1.98
32338587--32338623
19
1.9
19
88
0
56
16
10
29
43
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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0
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2.2
17
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0
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1.71
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29
19
28
1.98
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140
1.9
141
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375
22
29
19
28
1.98
32352271--32352533
94
2.8
92
78
11
293
22
29
19
28
1.98
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47
80
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24
28
17
29
1.97
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20
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20
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1.98
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2.0
196
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1.93
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1.97
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2.6
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25
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17
24
1.97
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2.0
23
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1.52
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19
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1.18
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17
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19
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2.0
24
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2
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1.54
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3.1
40
88
2
178
21
20
20
37
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
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0
0
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25
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46
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2.0
49
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26
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0
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49
20.4
49
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0
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20.4
49
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19.4
49
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0
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27
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4
30
33
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
32442420--32442502
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3
30
34
1.75
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0
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5
89
28
32
16
23
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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