Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  13  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3887491--3887540
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2.0
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2.0
23
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0
4
73
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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3
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23
2.3
23
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19
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2.1
42
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2.6
44
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149
35
13
22
27
1.92
4006947--4007080
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
4015683--4015735
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2.1
25
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72
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1
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0
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0
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2.2
21
88
0
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6
6
21
65
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
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1.19
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51
0
0
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1.00
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2.0
153
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15
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1.74
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21
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25
1.98
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0
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2.1
20
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0
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481
29
27
7
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1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4083751--4083812
32
1.9
32
100
0
124
30
29
9
30
1.89
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80
2.0
80
88
0
239
29
26
8
35
1.87
4083605--4083959
178
2.0
176
94
1
629
29
25
8
36
1.85
4083784--4084019
48
4.9
48
94
0
409
29
24
8
37
1.85
4086204--4086246
21
2.0
22
81
9
52
62
6
0
30
1.21
4086200--4086257
31
1.9
30
82
10
73
67
8
0
24
1.18
4092472--4092554
5
16.0
5
70
20
55
38
0
3
57
1.16
4093350--4093374
12
2.1
12
100
0
50
16
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4093352--4093460
45
2.4
45
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0
182
20
20
18
41
1.91
4093337--4093460
45
2.5
51
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15
152
19
20
19
40
1.92
4093635--4093807
18
9.6
18
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7
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12
13
36
1.83
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36
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8
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37
12
13
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1.82
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18
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18
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0
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10
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14
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14
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0
52
28
8
8
54
1.60
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21
2.7
19
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11
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52
5
9
32
1.57
4107877--4107917
16
2.6
16
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0
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24
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15
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64
10
0
24
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2.0
20
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3
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3
100
0
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0
0
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2.0
16
100
0
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6
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18
1.70
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5
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5
100
0
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19
19
19
1.90
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9
4.1
9
92
0
65
29
10
13
45
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4125546--4125578
9
3.7
9
91
0
57
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24
12
24
1.89
4125546--4125580
18
1.9
18
100
0
70
37
22
11
28
1.89
4126186--4126228
20
2.2
20
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8
61
18
4
0
76
0.95
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18
2.1
18
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0
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27
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2
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2.0
65
100
0
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7
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17
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32
15
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28
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4137093--4137305
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2.1
101
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347
30
15
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28
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2.0
22
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1.8
123
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1.93
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12
14
25
1.79
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4.2
33
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9
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12
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2.3
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22
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2.0
121
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0
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0
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0
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26
21
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28
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0
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19
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2.9
12
95
4
61
64
0
0
35
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4192931--4192991
28
2.1
30
81
9
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6
14
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1.68
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5.0
11
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18
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29
1.72
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18
2.1
18
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0
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27
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19
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0
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0
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0
0
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11
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34
0
0
65
0.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444