Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  41  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
25
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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10
1.22
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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34
1.73
10193574--10193608
19
1.9
17
88
11
52
77
8
0
14
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
25
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11
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63
5
1
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1.25
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2
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2
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0
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0
0
51
1.00
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26
7
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13
3.0
13
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0
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2
30
1.70
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26
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3
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28
5
3
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1.35
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13
100
0
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7
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1.83
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16
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1.73
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1.72
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0
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5
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0
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26
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73
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32
1.96
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15
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20
5
0
73
1.04
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0
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16
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1.72
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30
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0
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1.69
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0
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23
2.0
24
83
8
60
43
17
21
17
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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2.2
17
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5
56
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19
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36
1.82
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2.1
14
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0
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0
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4
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34
1.14
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0
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0
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0
0
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0
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2.0
23
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2
0
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0
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27
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1
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26
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2.1
26
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1.76
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14
100
0
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100
0
100
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0
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0
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11.3
3
93
0
59
64
0
32
2
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10300499--10300549
21
2.4
21
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18
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9
9
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41
1.71
10301293--10301471
89
2.0
89
87
0
259
39
16
15
28
1.89
10301583--10301660
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4.4
17
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10
7
19
1.50
10301580--10301658
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6
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1.54
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21
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0
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25
1.99
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2.0
31
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1.80
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0
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0
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1.20
10323314--10323363
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2.1
24
100
0
100
48
0
4
48
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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