Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  408  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118621164--118621242
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2.0
39
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3
1
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118621664--118621716
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63
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0
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0
0
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2.0
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58
58
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2.3
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58
4
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0
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2.0
23
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1.44
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16
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0
70
40
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5
20
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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0
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18
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2.1
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3
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58
1.47
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0
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2.2
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20.3
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24
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0
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30
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28
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2.1
21
86
0
61
13
13
0
72
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118762453--118762590
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5.7
24
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118766929--118766960
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6
100
0
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46
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18
18
1.84
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17
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1.09
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4
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118771811--118771975
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18
30
1.95
118774306--118774545
73
3.2
73
85
3
293
32
18
18
30
1.95
118774140--118774689
236
2.3
235
88
3
823
33
18
17
30
1.94
118774383--118774708
164
2.0
158
84
5
424
35
18
16
29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118782249--118782304
27
2.1
27
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0
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19
28
19
32
1.97
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8
5.9
8
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13
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2
2
31
1.16
118786522--118786565
16
2.7
15
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10
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2
2
31
1.19
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20
2.3
18
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14
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2
4
24
1.19
118786559--118786598
20
2.0
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1.23
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2.9
21
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6
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3
0
28
1.05
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2.3
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1.04
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1.49
118787316--118787484
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25
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1.49
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16
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0
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1.96
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17
27
1.96
118790531--118791204
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0
1170
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1.87
118795257--118795332
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2.3
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13
3
47
1.61
118795271--118795344
35
2.1
36
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2
132
32
13
4
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1.60
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16
188
24
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32
22
1.98
118796992--118797305
94
3.3
94
80
8
327
24
20
32
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
55
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26
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0
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0
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0
9
28
1.27
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1
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0
0
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0
0
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0
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0
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1.15
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0
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0
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0
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1.07
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4
0
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1.13
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6
0
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1.12
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0
0
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22
0
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118825281--118825330
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30
0
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7
0
42
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118835954--118835996
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19
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2.7
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42
1.54
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1.70
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2.2
63
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186
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0
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0
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0
0
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0
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0
0
50
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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