Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  394  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114356622--114357862
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422
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0
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0
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1.09
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2.9
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90
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27
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1.56
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2.3
64
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173
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2.0
25
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48
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3.2
39
94
0
207
21
20
30
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.9
39
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26
1.99
114403108--114403251
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1.8
78
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22
29
26
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0
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28
1.98
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78
1.8
78
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2
191
22
21
29
27
1.99
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0
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23
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119
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22
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2.1
37
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19
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2.0
33
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2.1
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12
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1.70
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2.0
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1.64
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114515317--114516053
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9.2
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73
14
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18
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114515696--114515730
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2.7
13
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0
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19
9
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254
2.3
248
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7
746
27
16
18
36
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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0
0.58
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0
0.62
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0
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1.97
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1.98
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1.93
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2.0
17
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50
60
3
0
36
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
26
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2.2
27
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5
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2.0
132
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1.96
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54
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17
24
23
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.86
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1.92
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1.9
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1
161
25
16
30
27
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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