Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  32  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7852348--7852597
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1.96
7852781--7852914
71
1.9
71
90
0
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29
23
16
30
1.96
7852941--7853074
71
1.9
71
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207
29
22
16
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0
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0
0
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0
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50
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17
17
1.79
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0
2
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10
4.9
10
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0
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20
1.22
7891646--7891694
20
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20
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0
89
67
0
12
20
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2.0
15
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2.0
195
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7905550--7905585
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2.0
18
94
0
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41
27
25
5
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7912778--7912857
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2.0
40
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4
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25
21
18
35
1.96
7915743--7915825
40
2.1
40
93
4
141
22
22
20
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1.97
7920418--7920546
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2.8
45
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4
152
34
13
24
27
1.93
7927809--7927937
44
2.8
45
82
4
152
34
13
24
27
1.93
7932206--7932277
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24
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26
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20
20
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1.9
41
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21
25
17
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2.0
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4.2
21
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10
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25
1
23
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0
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2.1
21
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0
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43
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278
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18
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1.97
7945151--7945217
31
2.2
31
83
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4
17
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2.2
21
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2.8
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32
8
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1.83
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26
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26
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218
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24
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1.78
7950111--7950244
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2.6
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95
2
236
36
24
5
33
1.78
7954199--7954338
27
5.2
28
90
5
184
35
22
24
17
1.96
7955951--7956083
26
5.2
26
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3
218
36
24
5
33
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7964812--7964913
37
2.6
38
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4
4
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1.41
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3.4
15
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2
50
51
5
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1.54
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2
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2
93
0
53
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3
48
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0
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1.27
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3.2
21
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1
4
59
1.26
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22
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1
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3.0
25
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33
5
8
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1.53
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12
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10
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1.80
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1.81
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14.0
10
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14
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2
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1.24
7977722--7977844
19
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19
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15
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2
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0
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17
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0
0
47
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7998727--7998761
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2.1
17
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0
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17
17
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19
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11
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61
9
1
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1.38
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20
3.7
19
75
16
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1
0
55
1.08
8013430--8013470
20
2.0
21
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13
59
39
0
0
60
0.96
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25
2.1
25
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3
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5
9
29
1.56
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4
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0
50
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5
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1.76
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23
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0
100
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0
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2.0
20
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2
2
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0
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1.55
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0
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1.13
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19
2.1
19
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4
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2
0
43
1.13
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0
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14
1.95
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9
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62
0
0
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0.95
8048917--8048956
17
2.4
17
100
0
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0
0
37
0.95
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2
2
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1.18
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8
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3
1
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20
3.1
19
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1
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1.28
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2.0
30
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3
0
57
1.15
8050752--8050799
14
3.2
15
79
5
53
14
4
2
79
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8050774--8050799
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3.7
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0
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11
0
0
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0.52
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2.7
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1.96
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2.0
31
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0
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1.68
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1.9
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6
2
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1.42
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0
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2.3
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0
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1.18
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0
0
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1.00
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0
0
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0
0
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0
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0
0
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0
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0
0
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1
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1.40
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18
2.0
18
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5
0
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3
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105
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1
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1.14
8102204--8102299
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5.2
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3
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1.15
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10
2
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2.5
19
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19
11
35
1.88
8109359--8110079
45
16.4
45
73
10
526
36
22
20
20
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8109359--8110045
88
7.8
88
73
10
397
36
22
20
19
1.95
8109448--8110046
132
4.6
132
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1
1006
36
22
20
20
1.95
8109448--8110046
265
2.3
264
93
1
1006
36
22
20
20
1.95
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175
1.9
175
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2
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35
22
20
21
1.96
8109575--8110146
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6.5
86
73
9
393
36
21
20
20
1.95
8110151--8110346
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2.9
68
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2
270
30
23
19
27
1.98
8110403--8111288
44
20.2
43
75
9
618
31
19
23
25
1.98
8110505--8111103
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4.5
132
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0
1027
30
19
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25
1.98
8110901--8111276
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1
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18
23
26
1.97
8110769--8111324
307
1.8
307
92
1
945
31
18
23
25
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444