Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  87  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20705505--20705570
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0
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0
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0
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2.7
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6
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0
0
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0
0
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0
0
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3.3
10
88
8
50
23
0
2
73
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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1
1
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68
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22
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0
50
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50
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102
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0
100
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14
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12
17
0
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2.0
31
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1
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2.2
39
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29
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57
81
0
0
18
0.70
20821912--20821942
9
3.3
9
95
4
53
80
0
0
19
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0
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0
0
48
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2.0
32
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119
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3
29
40
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20838623--20838666
12
3.2
15
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61
1.22
20838613--20838666
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26
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1.32
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21
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1.99
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88
2.4
88
89
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318
30
21
21
25
1.98
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22.5
2
95
0
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0
2
48
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38
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1.43
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19
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1.98
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2.0
46
97
0
177
19
13
15
51
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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22
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0
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0
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0
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44
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4
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26
14
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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3
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13
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26
0
31
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20979501--20979598
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2
1
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1.9
39
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1.78
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2.2
21
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0
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8
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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