Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  253  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72166805--72166852
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1.9
25
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0
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25
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1.96
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3.6
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2
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23
16
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28
1.96
72178031--72178133
29
3.6
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81
2
118
23
16
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1.96
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17
2.0
17
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0
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2.1
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0
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23
21
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1.92
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25
6.0
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1.98
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1.97
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68
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11
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30
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0
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0
50
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0
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10
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0
0
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1.00
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0
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0
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1.00
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0
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201
22
22
28
26
1.99
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3.5
28
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6
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29
26
13
29
1.94
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28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
72241210--72241310
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
72246469--72246619
80
1.9
79
89
5
232
24
22
27
25
2.00
72246469--72246636
40
4.2
39
85
6
205
23
21
28
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72246469--72246636
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79
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4
230
23
21
28
26
1.99
72248686--72248753
21
3.2
21
76
15
61
17
0
35
47
1.48
72248695--72248753
7
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18
0
35
45
1.50
72248696--72248766
34
2.1
34
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21
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0
0
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28
1.98
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2.9
93
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270
23
29
19
27
1.99
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8
378
23
28
19
28
1.99
72255592--72255697
24
4.4
23
87
7
149
39
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19
1.78
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27
2.9
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79
16
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24
34
1.95
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228
24
29
18
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1.98
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2.6
145
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403
24
29
18
27
1.98
72272673--72272707
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0
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0
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0
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52
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50
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3.2
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0
24
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17
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2.0
21
100
0
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37
20
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1.85
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2.0
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14
2.5
13
90
9
59
17
8
0
73
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72308059--72308157
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15
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1.96
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3.2
40
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24
28
23
2.00
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2.0
170
99
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671
36
15
22
25
1.94
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40
3.2
40
82
4
165
23
24
28
23
2.00
72323976--72324074
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28
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119
27
15
27
30
1.96
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28
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28
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119
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15
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1.96
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0
111
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12
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1.9
60
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15
17
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19
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24
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2.3
15
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0
52
28
37
22
11
1.89
72371316--72371348
5
6.6
5
100
0
66
78
0
0
21
0.75
72373626--72373666
20
2.0
20
95
0
73
46
4
14
34
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
28
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2
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28
14
25
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1.95
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27
2.1
27
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6
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31
15
22
31
1.95
72389126--72389248
42
2.9
42
72
9
106
17
31
23
27
1.97
72391703--72391739
14
2.5
15
91
8
67
21
32
32
13
1.92
72391725--72391855
63
2.1
63
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1
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19
22
26
30
1.98
72398078--72398344
142
1.9
142
85
1
374
28
19
27
24
1.99
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27
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27
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2
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30
28
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27
1.95
72407584--72407653
27
2.6
27
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30
28
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1.95
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2.1
46
100
0
190
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23
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1.98
72418570--72418818
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27
20
29
22
1.98
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21
21
29
28
1.98
72420228--72420398
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1.8
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1
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21
21
29
27
1.98
72423357--72423436
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10
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1.64
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30
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27
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27
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0
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19
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1.95
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20
24
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1.96
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2.7
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1.94
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24
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24
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15
20
1.88
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9
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68
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0
1
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1.07
72432043--72432120
20
3.9
20
78
10
88
48
0
1
50
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.4
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0
0
49
1.06
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0
0
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1.07
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25
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0
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1.88
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26
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0
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1.99
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80
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22
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1.99
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2.0
33
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0
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0
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0
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1.52
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0
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5
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1.73
72469895--72469994
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2.6
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5
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43
1.74
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1.9
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15
7
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1.75
72471900--72472011
28
4.0
28
73
4
73
36
20
11
31
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72473944--72474103
29
5.5
29
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25
31
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26
1.97
72482041--72482200
29
5.5
29
82
4
180
25
31
16
26
1.97
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2.8
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1.95
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1.95
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30
27
14
28
1.95
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1
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1.46
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0
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1.91
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1.99
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28
1.99
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18
2.7
18
84
6
55
30
2
12
56
1.47

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444