Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  37  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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32
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
23
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2
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22
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1
180
39
15
22
22
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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27
1.99
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22
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3.5
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1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9201761--9201785
12
2.1
12
100
0
50
24
24
24
28
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18
2.1
18
95
0
67
42
47
2
7
1.46
9211226--9211250
13
1.9
13
100
0
50
40
48
0
12
1.40
9211275--9211321
6
7.5
6
86
9
58
76
6
0
17
0.98
9211341--9211417
9
8.6
9
84
5
93
24
9
23
42
1.83
9214880--9214920
18
2.3
18
91
4
66
53
9
26
9
1.65
9214996--9215964
4
244.0
4
83
1
523
35
0
53
10
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9215968--9216067
2
50.0
2
90
4
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3
0
50
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1.16
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23
2.0
24
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4
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27
12
8
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1.69
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2
17.0
2
93
0
59
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0
0
52
1.00
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2.0
20
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0
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12
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13
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1.93
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44
2.8
45
82
4
152
34
13
24
27
1.93
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3.2
15
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19
50
42
1
1
53
1.23
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16
2.3
16
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13
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40
0
0
59
0.97
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2.0
35
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0
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2.1
137
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0
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1.98
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1.93
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26
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2
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18
2.1
18
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1.92
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16
17
33
1.93
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21
2.0
20
86
4
57
40
0
2
57
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9246232--9246312
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2.0
40
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0
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14
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12
2.1
12
100
0
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40
1.91
9246525--9246628
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2.3
45
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3
111
24
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78
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0
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0
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0
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2.0
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0
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0
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0
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0
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0
0
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1.00
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0
0
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0
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0
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130
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1.79
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20
2.0
20
100
0
80
35
15
15
35
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9344596--9344735
52
2.7
52
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3
192
26
18
25
29
1.98
9344590--9344761
52
3.4
51
82
9
160
27
17
25
30
1.97
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2
98
0
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0
0
1.04
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2.5
70
86
2
235
28
14
22
34
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444