Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  443  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128694114--128694142
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0
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0
0
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1.99
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2.7
38
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8
128
21
29
25
23
1.99
128714751--128714899
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
128714792--128714899
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
128728306--128728369
29
2.2
29
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13
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1
6
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1.89
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2.2
21
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0
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243
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17
28
23
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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1.00
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2
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24
2.5
24
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1.65
128810089--128810157
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2.3
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2.0
168
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420
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16
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0
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0
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20
84
11
56
27
4
0
68
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128856725--128856780
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3
0
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1.11
128856726--128856768
19
2.3
18
81
18
52
25
4
0
69
1.07
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1.9
19
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128870290--128870373
29
2.7
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4
0
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12.5
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1.60
128872395--128872471
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18
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5
6.0
5
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20
0
0
79
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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0
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1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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2
0
62
1.10

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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