Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  370  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107518111--107518152
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20
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20
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1.98
107549976--107550081
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151
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0
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26
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0
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75
28
0
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2.0
42
100
0
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26
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30
1.98
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74
2
0
23
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4.6
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11
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2
0
21
0.92
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2.3
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1
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0.95
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2.1
20
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50
40
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14
35
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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35
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21
2.1
21
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15
20
31
1.94
107599498--107599528
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2.1
15
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0
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0
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2.2
23
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19
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107613731--107613826
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2.2
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119
29
14
27
29
1.95
107614260--107614356
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2.2
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16
24
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1.96
107613485--107614357
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2.5
353
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24
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1.97
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2.3
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0
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0
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0
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38
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2.0
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74
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4.2
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1.82
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3.3
31
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1
141
33
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19
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65
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64
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107632659--107632754
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63
1
8
27
1.29
107633255--107633302
20
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0
25
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2.3
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23
21
33
1.97
107633663--107634262
88
6.8
88
84
1
729
21
23
21
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107634144--107634306
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3.7
45
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133
20
23
22
33
1.97
107634144--107634403
132
2.0
132
91
4
427
20
23
23
33
1.97
107634274--107636053
88
20.3
88
83
3
1980
22
22
21
34
1.97
107633970--107634570
307
2.0
309
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861
21
23
21
32
1.98
107634277--107636049
264
6.7
264
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2222
22
22
21
34
1.97
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2.5
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162
26
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20
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1.97
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107654720--107654792
29
2.4
30
80
11
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27
10
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45
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107654731--107654792
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30
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1.80
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107655172--107655235
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1.03
107655163--107655246
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2.3
37
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0
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1.94
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1.96
107689964--107690458
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188
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13
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0
0
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0.89
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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G
T
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(0-2)
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5
204
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11
14
36
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107738829--107738981
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14
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1.83
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3.3
20
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0
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0.74
107747518--107747613
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2.4
84
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3
307
31
21
22
24
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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