Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  348  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100806763--100806793
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12
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0
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0
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0
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0.82
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12
2.6
12
94
0
53
0
25
0
74
0.82
100814475--100814505
16
1.9
16
93
0
53
54
3
0
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1.16
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3
38.7
3
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19
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63
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6
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3.9
43
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130
23
23
21
30
1.99
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2.2
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21
23
23
30
1.99
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44
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138
27
23
21
27
1.99
100832784--100833377
320
1.9
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20
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1.98
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0
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17
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16
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0
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3
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0.75
100834331--100834406
28
2.8
28
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118
0
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0.76
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100
0
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0
18
18
1.32
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2
235
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1.35
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0
0
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200
20
20
27
31
1.97
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46
2.8
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188
20
21
26
31
1.98
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24
1.9
24
86
9
65
65
2
4
27
1.23
100848270--100848316
24
1.9
24
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60
36
0
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1.24
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0
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31
2
0
65
1.07
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15
2.4
14
90
5
50
52
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8
29
1.62
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0
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1.53
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2.5
11
100
0
54
33
18
7
40
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100862245--100862333
44
2.0
44
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4
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30
20
20
1.97
100864199--100864241
18
2.4
18
92
3
70
13
39
27
18
1.89
100865430--100865485
25
2.2
26
81
9
62
46
12
0
41
1.42
100865866--100865901
16
2.2
16
100
0
72
58
0
0
41
0.98
100865866--100865907
16
2.6
16
92
3
57
57
0
2
40
1.12
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1
482
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18
17
34
1.94
100869274--100869621
132
2.6
131
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0
462
28
19
16
35
1.94
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44
10.9
44
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2
633
28
14
30
26
1.95
100881226--100881703
88
5.4
88
89
1
715
28
14
30
26
1.95
100884498--100884895
131
3.0
130
84
1
481
29
18
16
34
1.93
100884504--100884896
132
3.0
130
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3
437
29
18
17
34
1.94
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13.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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18
2.2
17
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13
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23
1.14
100897445--100897473
14
2.1
14
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0
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34
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6
51
1.55
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35
4.5
35
82
7
133
32
19
20
27
1.97
100898242--100898397
70
2.2
70
81
4
172
32
19
20
27
1.97
100898343--100898399
17
3.1
19
71
23
59
35
22
15
26
1.94
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21
2.0
21
85
0
55
29
21
29
19
1.98
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25
3.7
25
82
10
102
30
21
29
18
1.97
100902294--100902375
25
3.2
26
84
10
107
32
20
26
19
1.97
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16
2.1
16
100
0
68
52
0
5
41
1.25
100914711--100914748
19
2.0
19
85
10
51
68
0
10
21
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100916899--100917012
41
2.8
41
90
5
169
18
24
42
14
1.87
100920221--100920260
21
1.9
21
94
0
71
25
17
47
10
1.78
100922738--100922780
21
2.1
20
82
4
50
44
2
37
16
1.60
100923860--100923969
26
4.2
26
94
2
177
34
4
24
36
1.76
100925404--100925478
26
2.8
26
81
4
78
34
21
12
32
1.90
100925582--100925720
27
5.2
27
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17
23
23
35
1.96
100925582--100925720
54
2.6
54
87
3
183
17
23
23
35
1.96
100925582--100925741
54
3.0
54
83
4
155
19
24
21
34
1.96
100929692--100929773
26
3.2
25
91
6
130
35
4
24
35
1.77
100931209--100931283
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2.8
26
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4
87
34
21
12
32
1.90
100931387--100931525
27
5.2
27
86
4
174
17
24
23
34
1.96
100931387--100931525
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2.6
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3
192
17
24
23
34
1.96
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27
17
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0
0
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0
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26
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4
21
1.68
100950914--100950988
2
39.5
2
72
19
54
40
2
1
56
1.22
100950920--100950991
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2.9
24
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2
1
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1.21
100950914--100951028
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1.9
60
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13
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5
2
55
1.36
100951003--100951061
25
2.5
24
78
10
68
33
8
6
50
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
25
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0
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2.7
24
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1
1
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1.11
100951220--100951279
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19
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1.59
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1.9
26
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4
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46
2
0
51
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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290
22
20
28
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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162
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24
32
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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