Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  438  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126953263--126953437
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75
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2.3
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1.17
126986868--126986948
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4.4
18
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13
76
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3
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1.17
126986863--126986949
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3.4
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3.1
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23
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132
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1059
26
23
19
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1.98
126987949--126988897
308
3.1
308
89
3
1288
26
23
19
31
1.98
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308
3.5
307
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1265
26
23
19
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132
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0
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267
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314
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21
21
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132
2.5
132
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2
481
19
21
22
37
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
34
1.97
126989356--126989905
175
3.2
176
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539
21
21
20
36
1.95
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20
21
21
37
1.95
126990015--126990141
66
1.9
66
95
0
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6.0
6
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2.5
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27
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50
0
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65
1
3
30
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1
3
30
1.17
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4.4
18
79
13
76
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1
3
29
1.17
126997008--126997094
27
3.4
27
71
19
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65
1
3
29
1.16
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2.0
20
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60
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126997424--126997475
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63
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0
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154
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127010102--127010725
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2.0
309
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22
7
19
1.73
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2.1
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23
0
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70
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20
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2
0
35
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
127020527--127020581
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39
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15
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1.73
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1
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18
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5
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2
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2
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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43
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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41
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.2
45
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10
171
29
24
15
30
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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