Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  241  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68281443--68282073
260
2.4
260
82
6
767
19
23
21
35
1.96
68281450--68282075
173
3.6
172
87
3
801
19
23
21
35
1.96
68294530--68294573
9
5.2
9
81
15
58
52
0
0
47
1.00
68294531--68294582
19
2.7
19
84
3
59
53
0
0
46
1.00
68297194--68297269
3
25.7
3
75
12
68
60
2
5
31
1.33
68297428--68297459
3
11.3
3
93
6
50
68
0
0
31
0.90
68297475--68297499
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
68299647--68299686
9
4.4
9
87
0
53
22
60
2
15
1.47
68302808--68302851
3
14.7
3
95
0
79
36
0
0
63
0.95
68304225--68304308
40
2.1
40
95
0
150
28
22
15
33
1.95
68305755--68305927
46
3.7
46
79
10
199
21
20
27
30
1.98
68305752--68305922
93
1.8
93
92
0
288
21
20
28
29
1.98
68310575--68310783
46
4.5
44
76
9
161
24
31
18
26
1.97
68310613--68310786
94
1.9
92
84
9
237
23
32
19
24
1.98
68314397--68314432
16
2.3
16
90
4
56
80
2
2
13
0.93
68319257--68319293
18
2.0
19
89
5
58
2
21
0
75
0.92
68319327--68319361
18
1.9
18
88
11
54
40
8
0
51
1.33
68320799--68320879
35
2.3
35
89
0
117
48
32
4
14
1.66
68322768--68322855
43
2.0
44
86
2
124
48
1
27
22
1.58
68324036--68324067
15
2.1
15
94
0
55
28
0
6
65
1.16
68326270--68326331
19
3.3
19
79
0
70
29
24
24
22
1.99
68328827--68328857
16
2.0
15
93
6
53
45
0
3
51
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68331258--68331634
48
7.9
48
94
1
621
35
6
29
28
1.83
68331773--68331844
37
1.9
37
94
0
126
23
19
29
27
1.98
68333857--68333939
3
28.7
3
75
11
57
57
1
38
2
1.19
68333857--68333939
11
8.5
10
72
17
52
57
1
38
2
1.19
68333855--68333939
14
5.7
14
69
12
53
58
1
37
2
1.18
68336917--68337019
29
3.6
29
81
2
118
23
16
32
28
1.96
68339403--68339427
10
2.5
10
100
0
50
24
0
8
68
1.16
68345546--68345607
27
2.3
27
91
0
97
27
16
16
40
1.89
68345563--68345713
54
2.8
54
84
2
151
29
9
19
41
1.82
68345561--68345713
81
1.9
81
85
5
211
30
9
18
41
1.82
68345590--68345713
27
4.6
27
83
2
160
30
7
19
42
1.78
68345697--68345767
27
2.6
27
75
4
72
29
7
26
36
1.83
68345590--68345713
54
2.3
54
91
0
194
30
7
19
42
1.78
68350150--68350325
38
4.6
39
92
4
281
28
28
21
20
1.98
68350149--68350355
38
5.5
38
86
9
239
27
29
22
20
1.98
68359799--68359847
14
3.6
14
80
2
55
69
0
26
4
1.06
68362995--68363029
14
2.5
14
90
0
52
48
5
2
42
1.41
68362947--68363139
62
3.1
62
94
0
323
38
5
6
49
1.53
68363009--68363187
48
3.4
48
69
21
144
37
6
7
49
1.56
68363009--68363243
110
2.1
110
95
1
418
37
6
7
48
1.57
68363119--68363261
62
2.2
64
92
4
236
39
7
6
46
1.58
68363167--68363201
14
2.5
14
90
0
52
48
5
2
42
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68363829--68363986
6
26.3
6
95
0
271
3
33
46
17
1.64
68364632--68364666
14
2.5
14
95
0
61
40
5
20
34
1.76
68375326--68375382
25
2.3
24
84
3
78
29
22
12
35
1.91
68375585--68375654
23
3.1
23
69
22
58
30
18
12
38
1.88
68377935--68377992
30
1.9
30
96
0
107
41
17
18
22
1.90
68380022--68380218
40
4.9
40
92
4
294
27
20
26
25
1.99
68380074--68380265
40
4.8
40
90
5
121
27
20
26
25
1.99
68380022--68380253
120
1.9
119
82
9
285
27
20
26
25
1.99
68388214--68388408
40
4.9
40
92
5
292
27
21
26
25
1.99
68388214--68388443
118
1.9
119
82
9
292
27
20
26
25
1.99
68391759--68391805
19
2.4
20
82
7
60
65
6
0
27
1.16
68391881--68391940
30
2.0
30
90
0
93
58
13
1
26
1.45
68391921--68391949
12
2.5
12
94
5
51
68
0
0
31
0.89
68393523--68393551
6
5.0
6
91
8
51
65
0
0
34
0.93
68393683--68393755
35
2.1
35
94
0
128
35
5
13
45
1.67
68403489--68403591
47
2.2
47
92
0
170
33
7
32
26
1.85
68405536--68405646
42
2.6
42
84
0
123
26
27
17
28
1.97
68405576--68405753
48
3.9
47
76
11
172
25
28
18
28
1.98
68407209--68407275
26
2.5
26
74
9
64
34
13
8
43
1.75
68409424--68409605
49
3.7
49
75
10
190
30
24
17
27
1.97
68409416--68409603
100
1.9
100
87
2
279
30
23
18
27
1.98
68411602--68411661
30
2.0
30
90
6
95
61
16
11
10
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68411593--68411653
15
4.1
15
76
17
65
62
14
13
9
1.55
68414641--68414815
49
3.5
49
77
10
194
29
26
18
25
1.98
68414633--68414820
100
1.9
100
88
2
288
29
25
19
25
1.99
68416822--68416881
30
2.0
30
83
6
77
61
16
11
10
1.55
68419873--68420055
49
3.7
49
80
3
204
30
25
16
26
1.97
68419865--68420062
100
2.0
102
88
3
301
30
25
17
26
1.97
68426297--68426397
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
68429037--68429203
46
3.6
46
80
8
160
31
16
26
25
1.97
68429223--68429350
49
2.6
49
79
7
143
31
21
25
21
1.98
68436182--68436215
13
2.4
14
85
14
52
76
0
11
11
1.02
68436243--68436275
16
2.0
17
88
5
50
75
0
24
0
0.80
68437369--68437427
29
2.0
30
86
3
84
38
6
25
28
1.81
68449234--68449287
27
2.0
27
85
0
72
40
7
12
38
1.72
68449521--68449587
35
1.9
35
93
0
116
25
20
26
26
1.99
68449556--68449740
50
3.7
50
86
1
246
26
19
25
28
1.99
68457522--68457697
46
3.8
44
77
15
153
27
19
30
22
1.98
68457671--68457724
28
2.0
28
89
10
85
25
22
29
22
1.99
68462416--68462532
43
2.8
42
76
5
110
29
16
23
29
1.96
68466109--68466138
6
5.0
6
91
0
51
80
0
16
3
0.85
68466108--68466167
18
3.5
17
76
17
61
75
1
16
6
1.10
68471094--68471201
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
68478470--68478577
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68483560--68483633
29
2.6
29
95
0
139
27
14
31
27
1.95
68483617--68483692
29
2.6
29
78
0
89
22
19
35
22
1.96
68483560--68483692
58
2.3
58
80
2
133
24
17
33
24
1.96
68486557--68486589
2
16.5
2
100
0
66
48
0
0
51
1.00
68488874--68488906
16
2.1
16
100
0
66
51
18
6
24
1.68
68496613--68496787
39
4.7
36
87
8
260
45
12
6
36
1.68
68496613--68496787
75
2.3
75
100
0
350
45
12
6
36
1.68
68503257--68503355
42
2.3
42
78
1
108
36
21
15
27
1.93
68503269--68503350
42
1.9
43
85
2
112
39
21
13
25
1.90
68509821--68509907
34
2.5
34
86
1
111
29
19
25
25
1.98
68517101--68517134
17
2.0
17
100
0
68
47
11
11
29
1.76
68521752--68521825
31
2.5
31
87
10
93
29
25
13
31
1.94
68521751--68521854
28
3.5
29
82
6
111
29
26
13
29
1.94
68529539--68529612
31
2.5
31
87
10
93
29
25
13
31
1.94
68529538--68529641
28
3.5
29
82
6
111
29
26
13
29
1.94
68533094--68533222
46
2.8
46
96
0
231
20
21
28
29
1.98
68538524--68538652
46
2.8
46
96
0
231
20
21
28
29
1.98
68539401--68539453
26
2.0
26
100
0
106
41
11
22
24
1.86
68550036--68550090
29
2.0
27
82
7
65
18
23
27
30
1.97
68555139--68555178
13
3.1
13
92
0
62
20
37
27
15
1.92
68559103--68559129
13
2.1
13
100
0
54
14
33
29
22
1.94
68566889--68566963
6
11.8
6
73
9
60
6
21
1
70
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68567723--68567777
27
2.0
27
100
0
110
43
7
25
23
1.79
68575541--68575634
29
3.2
29
96
0
170
26
28
15
28
1.96
68575503--68575634
58
2.3
58
84
2
167
25
33
15
25
1.95
68583501--68583594
29
3.2
29
96
0
170
26
28
15
28
1.96
68583463--68583594
58
2.3
58
84
2
167
25
33
15
25
1.95
68588568--68588609
20
2.1
20
100
0
84
26
9
14
50
1.73
68591368--68591407
21
1.9
21
89
0
62
27
37
17
17
1.92
68594132--68594314
43
4.3
42
79
4
170
31
28
15
24
1.95
68594115--68594358
86
2.9
85
83
4
260
34
26
14
24
1.94
68594166--68594358
85
2.3
86
83
2
246
35
26
14
23
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444