Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  99  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24057112--24057209
28
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28
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29
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2
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2
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16
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63
1.47
24072386--24072423
15
2.5
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0
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31
27
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19
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25
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30
14
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31
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44
3.9
44
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231
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19
22
28
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0
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4
4
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63
1.31
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2.5
15
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41
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11
113
32
27
17
23
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24138559--24138685
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18
22
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4
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0
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0
0.80
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2.0
25
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9
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24
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20
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21
26
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19
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2.0
19
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2.0
43
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37
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1.91
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18
2.6
18
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1.88
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18
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2
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137
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1.97
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2.0
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85
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74
24
15
22
37
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24203363--24203467
26
4.0
26
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0
183
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1.83
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2.1
137
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493
32
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1.97
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26
2.0
27
82
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22
15
24
37
1.92
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4.2
26
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0
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1.34
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5.5
205
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1.97
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2.5
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1.95
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1.96
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2.5
28
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2
124
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14
27
30
1.95
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3.0
27
85
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78
29
15
24
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1.96
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28
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29
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16
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1.96
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40
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28
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36
1.89
24249117--24249164
25
1.9
25
82
0
60
25
14
25
35
1.94
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27
17.7
27
85
4
579
41
8
21
28
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24251950--24252079
49
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50
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3
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33
18
24
23
1.97
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60
2.3
63
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14
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25
20
27
1.99
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1.9
16
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13
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16
53
1.73
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27
3.3
27
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4
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1.87
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31
9
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39
1.84
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27
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27
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11
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9
19
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1.84
24275137--24275551
134
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131
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7
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10
19
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15
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0
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0
0
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22
1.99
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27
22
22
1.99
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159
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1.99
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1.93
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54
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1.92
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1.9
54
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1.88
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1.82
24320963--24321156
27
7.2
27
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1
237
33
8
18
39
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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2
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15
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1.99
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27
1.9
27
88
0
77
42
15
9
32
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24369969--24370008
14
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10
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1.59
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2.1
28
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5
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1.19
24372301--24372360
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11
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1.94
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1.99
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1.99
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4.8
27
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0
177
31
17
16
35
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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