Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  417  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121031918--121032138
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4.8
46
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29
27
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21
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1.9
247
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17
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121039731--121039906
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3.8
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28
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1.8
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0
0
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2.3
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22
25
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121071982--121072265
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36
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150
37
14
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35
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5
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2.2
18
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0
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0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.43
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18
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4
0
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1.20
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2.0
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2.0
21
100
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1.55
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25
2.2
25
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0
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23
27
27
21
1.99
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2.2
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174
26
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24
1.98
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27
2.5
27
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70
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1.16
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1.9
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2.1
54
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170
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42
23
1.74
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2.0
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0
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18.2
44
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1000
27
14
29
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
17
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50
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17
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2
0.86
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129
1.9
131
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5
342
27
21
17
33
1.96
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3
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3
69
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5
27
1.32
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2.4
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10
59
48
0
0
51
1.00
121154768--121154847
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2.1
38
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92
41
2
2
53
1.27
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2.3
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191
44
0
2
51
1.21
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0
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22
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50
2.2
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35
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21
27
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121185072--121185189
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13
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46
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2
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16
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29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
G
T
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24
28
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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(0-2)
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0
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0.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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