Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  57  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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2.4
21
80
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59
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17
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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4
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24
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30
7
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0
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0
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17
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27
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2.2
30
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33
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14
29
28
1.95
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24
2.0
24
100
0
94
29
4
4
61
1.34
13924130--13924182
24
2.2
24
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70
30
7
3
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0
0
60
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0
0
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0.96
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19
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36
2
6
55
1.37
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24
2.5
26
76
17
67
40
0
5
55
1.22
13924308--13924594
139
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383
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4
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13924496--13924555
25
2.4
25
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10
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40
0
3
56
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137
2.1
137
84
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396
36
0
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1.9
13
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20
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2.2
18
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25
15
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23
2.4
23
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18
27
1.94
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18
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26
20
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7.2
26
84
8
240
34
5
23
36
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13932807--13932968
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55
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2.0
25
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20
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1.92
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24
6.2
25
89
8
224
34
5
24
35
1.78
13938689--13938821
50
2.7
50
96
1
241
33
5
24
36
1.78
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2.0
25
84
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37
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16
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14
2.0
15
93
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51
3
20
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68
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19
2.4
19
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20
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19
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27
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28
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2.0
131
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26
1.96
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19
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1
0
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5.9
15
80
19
92
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2
1
25
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
1
25
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10
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8
81
18
99
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2
1
25
1.03
13969597--13969644
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5
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2
22
1.05
13969579--13969694
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1
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1.94
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87
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26
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1.92
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18
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1.90
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1.9
112
85
7
300
29
15
19
35
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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12
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1.67
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12
209
26
30
18
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14033889--14033934
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15
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1.27
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0
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1.28
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1.98
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21
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1.99
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0
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24
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22
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1.97
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9.5
44
65
13
168
21
24
21
32
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444