Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  319  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.2
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204
11
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26
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1.80
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100
0
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2.0
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92095144--92095258
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23
16
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27
4.3
26
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149
36
23
23
16
1.94
92100952--92101066
54
2.1
54
88
3
169
36
23
23
16
1.94
92102679--92102812
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5.2
26
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1
218
36
23
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1.78
92104112--92104173
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2.4
25
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10
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51
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8
33
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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55
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7
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2.4
23
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52
3
0
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1.18
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66
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0
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64
25
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25
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23
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0
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24
2.1
24
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0
0
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1.9
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0
53
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0
22
35
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92163856--92163886
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1.44
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83
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201
49
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1.51
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35
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0
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18
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19
2.1
21
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34
18
9
37
1.83
92213907--92213936
13
2.3
13
94
0
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13
20
46
20
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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13
18
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1.89
92223603--92223677
36
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36
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30
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18
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14
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20
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0
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0.94
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2.9
24
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4
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46
8
5
39
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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40
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72
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0
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0
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0
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29
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0
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29
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2.0
30
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0
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31
22
8
37
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92368938--92369041
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1.9
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22
1.99
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21
29
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1.99
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80
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24
22
1.99
92385167--92385274
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128
21
29
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23
1.99
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1.9
55
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0
183
47
10
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23
1.79
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23
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1.99
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1.95
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23
29
19
27
1.98
92405028--92405338
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3.3
94
87
7
411
23
29
19
27
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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