Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  68  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16022739--16022772
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1.9
17
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29
0
0
70
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42
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0
170
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1.38
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59
21
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1.34
16048288--16048320
17
1.9
17
88
11
50
36
9
9
45
1.68
16051234--16051312
20
4.0
20
77
4
81
35
7
12
44
1.71
16051225--16051312
40
2.2
41
86
8
119
32
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13
45
1.73
16059668--16059701
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2.1
16
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0
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16
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2.0
142
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21
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100
0
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2.1
51
93
0
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20
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80
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50
42
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50
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2.1
26
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12
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1
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45
1.36
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29
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13
0
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100
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50
6
37
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1.53
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2.4
31
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112
23
13
9
52
1.70
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28
2.2
30
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103
31
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28
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159
2.0
158
88
2
478
37
15
14
32
1.88
16097727--16097757
9
3.3
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19
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2.1
29
90
0
95
22
6
21
49
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16106833--16106898
29
2.3
29
97
0
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48
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10
34
1.62
16106952--16107056
52
2.0
52
94
0
183
34
2
26
36
1.72
16107811--16108312
127
4.0
127
90
1
729
37
17
16
28
1.92
16110002--16110051
14
3.6
14
78
10
66
54
4
4
38
1.38
16110002--16110059
28
2.1
28
100
0
116
55
6
3
34
1.44
16113166--16113683
45
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71
10
284
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21
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32
1.97
16113227--16113695
130
3.6
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88
2
575
26
21
19
32
1.97
16113435--16113680
41
5.7
45
74
12
183
25
21
20
33
1.97
16124718--16125080
127
2.9
126
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7
396
36
16
15
30
1.91
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127
1.8
127
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0
432
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15
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1.92
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19
2.0
19
94
0
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10
23
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1.89
16132090--16132202
30
3.8
30
92
0
190
25
6
51
16
1.68
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133
4.4
133
91
1
918
28
25
18
28
1.98
16132595--16133176
265
2.2
266
93
0
1006
28
25
18
28
1.98
16134055--16134088
16
2.1
16
88
0
50
55
20
2
20
1.56
16134390--16134428
17
2.5
15
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53
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2
38
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2.0
19
94
0
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34
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16
88
3
59
9
7
0
83
0.81
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4.8
129
89
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948
21
33
17
27
1.96
16138677--16139283
44
14.4
44
90
8
978
21
33
17
27
1.96
16138677--16139297
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7.4
84
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5
949
21
32
17
27
1.96
16139488--16139610
61
2.0
64
88
7
191
38
12
16
33
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16150282--16150319
19
2.0
19
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0
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31
23
10
34
1.89
16158076--16158118
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17
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0
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0.80
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32
17
27
1.96
16158402--16159008
44
14.4
44
91
6
987
22
32
17
27
1.96
16158402--16159008
171
3.6
171
91
6
1012
22
32
17
27
1.96
16159214--16159336
61
2.0
64
88
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191
38
12
16
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1.85
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19
2.0
19
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0
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10
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26
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1.76
16175461--16175503
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10
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15
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80
0
2
16
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0
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1
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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26
17
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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T
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0
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1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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108
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1.93
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55
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10
28
30
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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