Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  415  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120427242--120427291
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21
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0
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0
5
80
0.88
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2
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20
1.9
20
88
0
58
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1.23
120427817--120427944
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65
2
7
25
1.30
120427817--120427947
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70
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25
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0
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0
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66
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0
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2.5
48
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0
0
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47
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2
137
46
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4
36
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
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0
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0
29
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2.0
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10
12
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120496308--120496393
16
5.4
16
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0
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32
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120496308--120496393
32
2.7
32
85
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127
39
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22
32
1.78
120496375--120496468
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2.1
44
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31
1.92
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18
1.02
120505832--120505904
31
2.4
31
77
11
78
75
2
1
20
1.00
120505846--120505897
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0
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12
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18
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2.8
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1.13
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2.0
24
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38
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17
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1.9
31
86
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84
49
0
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30
1.49
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30
0
0
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34
4
23
37
1.75
120512628--120512725
26
3.8
26
97
0
169
33
5
25
35
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120517571--120517603
17
1.9
18
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52
45
0
12
42
1.41
120520010--120520050
20
2.0
20
85
0
55
43
9
7
39
1.65
120521879--120521931
18
2.9
18
85
0
70
41
16
7
33
1.77
120522069--120522187
48
2.5
48
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2
159
34
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19
20
1.96
120523189--120523220
2
16.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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18
8
8
64
1.46
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24
2.0
24
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16
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45
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2.0
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82
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0
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28
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0
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1.08
120572964--120573040
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0
2
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1.11
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2.0
21
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61
7
4
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19
1.9
19
88
0
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32
8
0
59
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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28
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2
2
46
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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40
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
48
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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