Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  18  of  444  ( 53255 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
17
25
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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1
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2.9
138
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20
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13
4
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2.4
21
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15
63
28
11
0
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3.2
24
73
13
72
63
6
3
26
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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2.1
22
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0
9
29
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5259189--5259263
36
2.1
37
87
2
107
34
12
16
37
1.85
5262037--5262088
2
25.5
2
84
11
70
46
3
1
48
1.31
5262608--5262646
2
19.5
2
100
0
78
48
0
0
51
1.00
5270429--5270478
15
3.4
15
76
13
50
42
0
2
56
1.11
5278305--5278340
3
12.0
3
100
0
72
33
0
0
66
0.92
5278534--5278578
23
2.0
23
86
0
63
33
0
4
62
1.15
5281686--5281792
26
4.1
26
96
0
196
35
26
6
31
1.82
5293361--5293442
43
1.9
43
84
0
110
48
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21
14
1.80
5294260--5294505
89
2.7
90
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2
379
28
17
21
33
1.95
5294440--5294589
73
2.0
73
84
2
192
29
18
20
32
1.96
5294569--5294603
14
2.5
14
95
0
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17
14
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60
1.58
5294584--5294729
75
2.0
72
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4
247
28
17
23
30
1.97
5294765--5294914
73
2.0
73
87
2
210
28
17
21
33
1.96
5294332--5294995
325
2.0
325
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0
1204
26
18
20
34
1.96
5294820--5295138
176
1.8
176
84
2
435
27
17
19
36
1.94
5294820--5295213
88
4.5
87
80
6
384
26
16
18
37
1.92
5296925--5296985
3
20.3
3
100
0
122
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0
0
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2.0
23
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0
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33
0
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1.15
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24
1.9
26
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35
0
6
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1.23
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26
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26
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247
34
6
23
35
1.80
5298953--5299114
78
2.1
78
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0
279
34
6
23
35
1.80
5303065--5303089
13
1.9
13
100
0
50
20
32
24
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5306055--5306138
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3.2
26
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0
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4
25
36
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26
3.2
26
96
0
150
33
4
25
36
1.77
5320147--5320338
7
27.1
7
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18
51
58
0
5
35
1.25
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28
2.2
29
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19
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57
0
6
36
1.25
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105
57
0
6
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1.24
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16
2.1
15
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5
57
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0
0
36
0.95
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2.8
12
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63
0
0
36
0.95
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20
2.3
19
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0
0
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0.91
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1.9
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10
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14
10
35
40
1.80
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205
2.5
204
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2
780
28
21
18
31
1.97
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499
2.0
499
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0
1730
26
22
19
32
1.97
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7
20.6
7
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19
52
59
0
5
35
1.21
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21
3.1
21
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61
0
4
33
1.16
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2.2
29
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19
67
59
0
4
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1.19
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1.9
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35
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1.76
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3.2
26
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0
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36
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1.77
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2.0
30
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1
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1.17
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20.3
3
100
0
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0
0
32
0.91
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3
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14
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3
4
30
1.32
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10
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68
0
3
27
1.06
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19
3.4
19
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67
71
0
3
25
1.01
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3
10.0
3
92
0
51
63
0
0
36
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5346160--5346499
123
2.8
118
84
10
415
57
7
5
28
1.50
5347505--5347549
23
2.0
23
100
0
90
33
0
22
44
1.53
5351043--5351189
64
2.3
64
91
1
233
26
17
12
43
1.85
5358041--5358071
14
2.2
14
94
0
53
64
0
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32
1.09
5358056--5358119
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20
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6
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70
6
4
18
1.27
5358998--5359055
28
2.1
27
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55
6
15
22
1.64
5359196--5359238
16
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15
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0
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1.51
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131
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0
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0
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2.1
12
100
0
50
36
40
16
8
1.77

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444