Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  9  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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11
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1
0
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1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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0
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30
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0
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2.0
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1
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2.0
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19
39
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
142
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20
1.96
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2.2
19
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1.80
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1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2870131--2871411
460
2.8
459
99
0
2521
35
11
11
42
1.77
2877181--2877220
21
1.9
21
100
0
80
25
15
57
2
1.50
2877522--2877641
44
2.8
44
85
1
170
25
20
23
31
1.98
2878577--2878624
5
9.8
5
95
4
89
81
0
0
18
0.70
2884639--2884767
29
4.5
28
74
13
113
51
5
1
41
1.34
2884723--2884779
24
2.5
24
83
11
75
54
1
0
43
1.10
2884636--2884779
29
4.8
32
74
13
110
52
4
1
41
1.31
2884630--2884802
60
2.9
61
85
1
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51
5
2
39
1.41
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21
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22
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47
0
5
47
1.26
2897523--2897555
2
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2
100
0
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0
0
51
1.00
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46
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1
299
41
13
23
21
1.89
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17
2.0
17
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0
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5.0
10
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21
2.1
22
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4
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2
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1.31
2907301--2907340
21
1.9
21
84
0
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7
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10
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21
2.0
22
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28
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21
1.63
2913560--2913601
11
4.0
10
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3
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28
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47
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1.63
2921474--2921573
27
3.7
28
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1.86
2921474--2921580
54
2.0
54
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7
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10
30
1.87
2921476--2921592
54
2.2
53
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10
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37
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29
1.88
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27
10.8
27
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320
27
23
7
40
1.82
2921728--2921886
54
3.0
54
83
4
144
28
20
8
42
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2921853--2921976
27
4.6
27
84
2
169
41
20
8
30
1.81
2921853--2921976
53
2.3
54
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4
180
41
20
8
30
1.81
2922015--2922066
27
1.9
27
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7
79
40
11
11
36
1.78
2922120--2922184
27
2.4
27
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5
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20
24
20
1.96
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25
1.9
25
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0
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25
1.94
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9
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15
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33
1.84
2923429--2923499
20
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20
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0
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30
1.88
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23
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23
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28
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1.99
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47
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29
23
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1.99
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2.1
31
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0
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1.92
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17
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19
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8
154
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1.82
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14
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1.83
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2.2
42
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0
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20
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27
1.88
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25
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26
20
23
28
1.99
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2.9
27
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20
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35
1.96
2935468--2935572
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10
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1.85
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1.81
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27
2.2
27
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0
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1.77
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27
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27
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0
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40
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29
1.83
2935725--2935922
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54
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20
33
1.83
2938733--2938828
41
2.4
41
87
5
133
38
20
20
19
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2938986--2939030
14
3.2
14
80
0
54
26
0
24
48
1.51
2939001--2939097
49
2.0
46
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5
158
29
2
25
42
1.67
2938997--2939083
21
3.8
21
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19
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1
27
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2939603--2939647
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14
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0
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1.51
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0
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1.81
2955310--2955417
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0
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27
96
0
95
32
5
28
32
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
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