Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  341  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98649855--98649928
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1.9
38
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0
112
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12
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1.11
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50
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0
1.00
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40
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27
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25
1.99
98663694--98663860
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
98664686--98664731
17
2.5
19
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22
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34
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17
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1.96
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10
232
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95
10
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1.67
98677311--98677486
46
3.8
46
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232
20
21
29
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1.8
93
96
0
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20
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10
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3.0
29
81
8
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10
17
16
56
1.67
98682895--98683070
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
98682891--98683062
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1.8
93
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0
317
20
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1.98
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3.5
50
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160
26
31
15
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1.96
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46
7.5
47
74
13
227
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1.97
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235
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29
20
28
1.98
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21
2.0
21
85
5
55
22
27
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12
1.90
98692948--98693080
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2.7
51
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11
152
24
30
18
27
1.98
98693051--98693165
46
2.5
44
80
6
115
26
26
18
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98699586--98699622
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2.1
18
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0
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5
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37
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2
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2
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0
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0
0
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7
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7
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57
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15
1.38
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28
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29
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19
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4
0
47
1.22
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25
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2.0
78
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2
262
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28
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14
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1.95
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75
30
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1.95
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28
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118
29
14
26
28
1.95
98734054--98734129
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
98738106--98738276
46
3.7
46
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132
30
19
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1.98
98738054--98738275
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2.4
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204
30
19
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23
1.98
98745782--98745899
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18
28
24
1.98
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50
24
18
22
34
1.96
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4.2
40
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169
25
21
27
25
1.99
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17
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50
24
18
22
34
1.96
98759403--98759569
40
4.2
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79
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169
25
21
27
25
1.99
98767322--98767463
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38
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23
28
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25
2.00
98767354--98767502
40
3.8
40
81
6
144
22
26
22
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98775386--98775531
40
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40
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175
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27
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26
2.00
98777645--98777812
40
4.2
40
81
6
198
28
26
20
23
1.99
98777641--98777812
80
2.2
79
85
4
231
28
26
21
23
1.99
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31
3.5
35
87
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126
22
23
16
38
1.93
98778876--98778970
31
3.1
31
95
0
172
22
22
15
40
1.91
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24
7.0
24
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257
26
22
22
28
1.99
98779161--98779328
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2.3
71
90
4
257
26
22
22
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1.99
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20
3.0
20
92
0
104
32
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11
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1.9
25
86
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25
16
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96
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25
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1.98
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2.7
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20
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27
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98792773--98792918
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3.7
40
84
7
181
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27
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23
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2.2
19
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0
2
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19
2.3
20
85
11
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35
0
2
62
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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98832373--98832557
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3.4
54
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18
20
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1.95
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19
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1.95
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2.3
26
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2
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21
23
20
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
98899976--98900106
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58
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2.1
20
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0
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35
11
2
50
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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133
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1.99
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5
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22
25
23
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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