Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr10 129486693 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  95  of  444  ( 53255 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.2
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2.0
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4.5
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100
0
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0
14
0.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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(0-2)
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2.9
94
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2
269
26
20
30
23
1.98
23047041--23047361
48
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20
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1.99
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2.3
142
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396
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20
29
23
1.99
23047143--23047362
94
2.3
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278
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20
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1.9
106
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19
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1.84
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2.0
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2.6
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7
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1.82
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3.1
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2.9
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1.9
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20
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20
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1.98
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31
2.1
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0
64
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23069446--23069505
30
2.0
30
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10
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0
0
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19
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0
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0
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23072112--23072186
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23072450--23072560
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26
2.0
26
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7
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15
24
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21
2.1
20
87
12
61
18
11
20
48
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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22
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0
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12
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1.99
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33
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38
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1.98
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20.5
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2.1
29
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0
102
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13
31
25
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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54
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0
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20
10
33
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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