Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  430  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
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Score
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Indices
Period
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Copy
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Consensus
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Score
A
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(0-2)
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124535789--124535828
21
1.9
21
94
0
71
42
15
25
17
1.88
124543583--124544053
43
10.7
44
64
14
191
26
21
26
25
1.99
124543574--124544187
133
4.6
133
93
0
1023
27
21
25
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
124545348--124545470
3
41.0
3
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12
94
63
1
4
30
1.22
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30
2.3
30
84
0
93
23
2
44
28
1.67
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135
2.6
132
90
3
501
29
19
22
28
1.98
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26
2.6
25
78
4
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27
9
1
61
1.35
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19
2.2
19
90
0
64
51
0
9
39
1.35
124550620--124550754
39
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39
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0
243
17
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100
0
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0
0
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0.96
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2.1
20
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2
2
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1.20
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19
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19
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0
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23
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0
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0
0
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15
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2
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0
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1.39
124570305--124570365
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1.93
124570304--124570377
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1.86
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39
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0
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1.89
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1.94
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1
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25
14
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1.94
124577537--124577716
31
5.8
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2
245
27
27
18
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1.98
124577699--124577820
50
2.4
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187
27
22
14
36
1.93
124577936--124577964
14
2.0
15
93
6
51
55
17
6
20
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
38
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4
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45
1.55
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2.2
33
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2
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2.2
19
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0
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13
4.0
13
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1
0
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1.10
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2
0
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1.08
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23
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1.9
138
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20
23
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1.91
124599921--124600193
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6.0
46
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21
23
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1.90
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100
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22
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0
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0
16
0
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2.0
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100
0
138
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10
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0
5
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1.17
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22
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0
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2.0
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1.55
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205
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1.61
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7
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42
2
0
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1.12
124627085--124627131
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42
2
0
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1.12
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0
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0
0
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2.3
27
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12
76
54
1
1
42
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
124637747--124637803
29
2.0
29
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0
1
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1.10
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2.0
18
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0
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1.92
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0
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0
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1.27
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30
20
1.63
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2.1
13
100
0
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0
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2.0
25
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0
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5
17
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0
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53
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1.44
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15
2.1
15
100
0
64
28
15
0
56
1.40

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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