Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  350  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101399084--101399118
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17
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0
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6.5
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90
0
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1.95
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132
2.3
132
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1
519
26
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14
27
1.95
101422183--101422207
13
1.9
13
100
0
50
32
4
16
48
1.64
101422421--101422452
2
16.0
2
100
0
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0
0
50
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2.0
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78
13
83
12
3
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1.15
101449442--101449509
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10
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0
0
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0
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2.0
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0
0
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0
0
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5.0
22
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1
1
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1.20
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0
0
22
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14
1.02
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5.4
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22
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3
0
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3.0
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0
1
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1.08
101460349--101460419
11
5.6
13
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18
62
57
0
1
40
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101460496--101460549
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0
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4
52
57
0
0
42
0.99
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0
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1.08
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0
0
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22
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0
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2.3
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97
44
23
10
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28
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29
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25
25
22
25
2.00
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1.30
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2.4
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97
0
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5
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15
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10
6
65
1.43
101485189--101485270
14
5.7
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74
18
68
18
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6
67
1.38
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2.0
28
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94
19
3
26
50
1.64
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2.8
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79
5
62
12
25
31
31
1.92
101489038--101489097
21
2.8
21
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31
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101500734--101500763
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2.0
15
100
0
60
6
20
0
73
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101500806--101500844
12
3.3
12
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20
2
5
71
1.17
101500806--101500837
11
2.8
11
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4
55
18
0
6
75
1.01
101500871--101500926
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3.0
19
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55
10
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7
76
1.14
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1.9
13
100
0
50
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1.9
16
93
0
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9
29
1.88
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2.3
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90
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10
1.28
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1.9
17
93
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1.10
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0
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19
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5
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1.28
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0
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0
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0.95
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10
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0
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0
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0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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0
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14
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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T
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1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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174
24
29
18
27
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
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