Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  66  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15625140--15625234
9
10.4
9
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1
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62
1.24
15625140--15625214
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36
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0
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1.12
15625140--15625214
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17
78
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32
0
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64
1.12
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28
2.1
28
81
6
68
38
1
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56
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15632339--15632433
9
10.4
9
75
15
88
31
1
5
62
1.24
15632339--15632413
36
2.1
36
85
9
100
32
0
4
64
1.12
15632339--15632413
19
4.2
17
78
17
80
32
0
4
64
1.12
15635273--15635582
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127
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14.7
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6
191
21
23
20
34
1.97
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128
2.5
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37
17
15
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29
2.2
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80
14
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1
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1.28
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2.0
27
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24
15
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1.92
15664037--15664144
25
4.2
26
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2
184
37
25
4
33
1.76
15664037--15664144
51
2.1
51
94
3
191
37
25
4
33
1.76
15666481--15666581
30
3.4
30
86
2
123
42
36
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11
1.73
15667900--15668006
7
15.7
7
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18
50
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4
0
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1.20
15667908--15668041
21
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21
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5
0
58
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136
2.1
136
98
0
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31
25
18
24
1.98
15671158--15671267
26
4.2
26
97
0
184
36
24
5
33
1.79
15672988--15673197
41
5.1
41
85
2
269
37
21
19
21
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15673813--15673862
24
2.1
24
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0
100
52
0
4
44
1.20
15674453--15674537
22
3.9
22
89
3
118
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1
1
21
0.92
15674453--15674530
29
2.7
29
90
2
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0
1
20
0.83
15674471--15674530
7
8.4
7
92
3
102
83
0
0
16
0.65
15679406--15679459
6
8.7
6
76
15
56
20
1
3
74
1.07
15682340--15682467
19
6.9
19
89
7
210
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10
14
37
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15682340--15682474
54
2.5
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90
6
215
37
10
14
37
1.81
15682340--15682467
37
3.5
37
92
5
215
37
10
14
37
1.81
15682340--15682490
19
7.8
22
86
8
103
37
9
14
38
1.80
15699319--15699700
49
7.8
49
96
0
683
27
8
34
29
1.87
15699794--15699880
37
2.4
36
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5
129
26
19
31
22
1.98
15701964--15702074
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29
93
0
186
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17
31
24
1.97
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2.6
40
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1
120
27
21
25
24
2.00
15702566--15702685
40
3.0
39
76
6
114
28
22
25
24
1.99
15704894--15705324
49
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49
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0
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27
8
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29
1.87
15705076--15705160
27
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37
2.3
37
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20
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1.97
15709141--15709201
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75
17
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0
8
8
0.81
15709140--15709202
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82
0
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9
0.84
15710144--15710897
205
3.7
205
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1
1284
30
18
21
29
1.97
15711107--15711149
19
2.3
19
83
0
59
37
13
18
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1.90
15711131--15711785
203
3.2
204
94
1
1124
31
18
21
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15711999--15712036
19
2.0
19
100
0
76
31
10
21
36
1.87
15712275--15712753
175
2.8
174
88
2
698
32
20
19
27
1.97
15712488--15712789
87
3.5
87
68
13
233
32
18
20
28
1.97
15712781--15712917
45
3.1
45
86
4
172
31
13
28
26
1.94
15713267--15713411
19
7.9
19
87
9
230
37
10
14
37
1.80
15713267--15713411
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2.7
54
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263
37
10
14
37
1.80
15713275--15713411
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85
10
199
37
10
13
37
1.81
15713266--15713418
73
2.1
71
88
8
229
38
9
15
36
1.80
15713267--15713434
19
8.8
22
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17
93
37
9
14
38
1.79
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2.0
29
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112
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2.1
21
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9
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9
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0
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21
2.5
22
81
9
74
37
41
13
7
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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15748829--15748936
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2.1
63
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0
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22
27
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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15814745--15814802
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1.9
43
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18
26
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15819810--15819918
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2
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4
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1.76
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126
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123
39
25
5
30
1.78

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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