Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  346  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100310476--100310583
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2.1
51
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0
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15
11
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1.82
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0
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2.0
20
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10
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30
5
20
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1.73
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7
331
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18
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1.98
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3.4
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0
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27
18
28
25
1.98
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2.2
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392
27
18
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26
1.98
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1.9
106
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2
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3.2
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29
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34
1.84
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2.1
47
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30
28
7
32
1.84
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4.3
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21
1.99
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2.1
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21
1.99
100324962--100325087
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3.2
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0
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22
1.99
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29
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20
1.98
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78
2.1
78
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208
26
29
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21
1.99
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0
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21
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15
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2.0
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90
0
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6
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50
20
0
30
1.49
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3.6
33
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4
116
43
35
7
14
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100364299--100364439
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5.2
27
82
11
182
34
22
24
18
1.96
100364299--100364442
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2.7
54
94
2
245
34
22
25
18
1.96
100364459--100364610
75
2.0
75
100
0
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13
26
1.93
100364618--100364682
26
2.4
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105
26
16
26
30
1.97
100366134--100366215
26
3.2
26
92
0
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7
32
1.82
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2.8
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22
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9
66
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9
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60
3
0
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1.12
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115
32
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27
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12
0
38
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11
2.5
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11
51
48
10
0
41
1.37
100376576--100376623
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52
10
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2.0
24
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51
17
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31
1.46
100377356--100377390
18
2.0
18
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54
11
14
2
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1.25
100377402--100377474
15
5.3
15
71
18
54
45
0
2
52
1.15
100392767--100392807
21
2.0
21
85
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48
24
0
26
1.51
100397036--100397128
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1.9
48
85
8
127
59
0
3
37
1.14
100397059--100397133
29
2.5
30
85
6
100
62
0
1
36
1.04
100397059--100397131
9
7.4
10
74
13
71
61
0
1
36
1.05
100397549--100397599
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75
13
50
43
0
0
56
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100397544--100397624
20
4.2
20
71
21
73
43
2
0
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1.13
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42
3
0
53
1.18
100397756--100397832
10
7.5
10
77
10
57
35
3
1
59
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100398901--100398952
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2.1
25
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38
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13
38
1.77
100399653--100399712
21
2.9
20
74
13
59
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1
1
28
1.09
100399657--100399724
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3.4
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1
30
1.10
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3.0
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12
11
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175
20
19
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1.97
100407985--100408032
14
3.4
14
75
11
53
29
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14
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1.73
100407975--100408033
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2.1
28
96
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2.0
18
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22
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2.0
18
88
0
54
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22
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27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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T
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1.99
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1.99
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183
22
30
24
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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