Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  15  of  444  ( 53255 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4546038--4546197
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38
10
16
34
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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4
603
31
15
19
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1.93
4620332--4620920
217
2.7
217
97
2
1093
32
15
20
31
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4620332--4620920
147
4.1
140
92
4
980
32
15
20
31
1.94
4620352--4621021
147
4.7
142
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10
686
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16
21
31
1.95
4620971--4621125
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3.0
52
81
11
194
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16
18
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1.93
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2.0
35
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2.3
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17
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10
58
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3
1
23
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4632322--4632361
19
2.2
18
86
13
55
72
0
7
20
1.08
4632592--4632720
9
13.4
9
67
16
64
75
2
5
16
1.08
4632624--4632665
8
5.0
8
91
8
66
83
0
4
11
0.79
4632604--4632717
13
8.3
13
68
19
63
76
2
6
14
1.09
4632624--4632665
17
2.5
16
88
11
66
83
0
4
11
0.79
4632694--4632749
17
3.4
17
88
9
80
80
1
7
10
0.97
4635570--4635661
46
2.0
46
97
0
175
40
18
17
23
1.91
4636102--4636233
27
4.9
27
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1
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21
25
29
23
1.99
4639719--4639830
33
3.4
32
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9
109
28
10
42
17
1.83
4641841--4641904
22
2.9
22
77
13
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62
4
0
32
1.16
4641878--4641919
16
2.9
15
86
13
61
59
7
0
33
1.25
4642055--4642227
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3.1
54
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19
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12
1
35
1.47
4642031--4642631
112
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112
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2
1028
50
15
1
32
1.53
4642031--4642631
223
2.7
224
94
2
1046
50
15
1
32
1.53
4642903--4642944
22
1.9
22
95
0
75
2
42
0
54
1.13
4644422--4644448
14
1.9
14
100
0
54
37
7
11
44
1.68
4645273--4645364
42
2.2
42
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3
123
41
21
9
27
1.84
4645506--4645671
23
7.1
23
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2
251
28
21
22
28
1.99
4645504--4645671
47
3.6
47
91
0
266
27
21
22
28
1.99
4645506--4645673
70
2.4
71
89
2
259
27
20
22
28
1.99
4645718--4645768
20
2.5
20
93
0
84
31
21
11
35
1.90
4645805--4645852
25
1.9
25
91
0
78
25
14
25
35
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4647016--4647093
27
2.9
27
77
7
86
19
19
21
39
1.92
4647134--4647185
27
1.9
27
84
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70
36
13
11
38
1.81
4647197--4647321
27
4.7
26
74
11
85
28
8
21
40
1.83
4647224--4647336
27
4.2
27
79
4
120
30
8
23
38
1.85
4647196--4647336
54
2.6
52
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6
131
29
9
22
38
1.85
4647315--4647767
27
16.8
27
82
4
470
41
7
23
27
1.81
4647764--4647862
27
3.7
26
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101
30
10
20
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1.85
4647745--4647867
54
2.3
54
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135
30
9
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38
1.86
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18
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1.83
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2.0
87
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1
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36
28
10
23
1.88
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2.2
42
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123
41
21
9
27
1.84
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23
7.1
23
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269
28
21
21
27
1.99
4651060--4651226
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3.6
47
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1
284
28
22
21
28
1.99
4651062--4651228
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2.4
70
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3
275
28
21
22
28
1.99
4651273--4651323
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2.5
20
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0
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21
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1.9
25
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0
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25
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25
35
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2.9
27
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19
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1.92
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1.9
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27
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1.83
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27
15.8
27
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39
6
24
28
1.81
4652866--4653295
81
5.3
81
86
5
544
39
6
24
28
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4653292--4653390
27
3.7
27
81
5
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10
20
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1.85
4653284--4653388
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2.0
53
81
9
124
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10
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1.87
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3.9
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5
100
0
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19
19
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0
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24
1.83
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87
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0
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0
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0
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3.3
9
91
8
53
19
0
0
80
0.71

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444