Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  427  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123514575--123514642
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2.3
30
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23
21
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2.5
172
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19
23
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50
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2.2
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27
27
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1.96
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3.4
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4
127
25
22
12
39
1.89
123560333--123560410
31
2.5
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90
56
3
0
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1.18
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39
79
9
285
28
15
21
34
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123570926--123571489
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28
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21
34
1.94
123570971--123571481
110
4.7
108
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4
503
27
15
21
35
1.94
123570926--123571489
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7.7
73
80
7
515
28
15
21
34
1.94
123574563--123574587
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254
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23
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2.00
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5.5
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282
27
27
22
23
1.99
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123608167--123608267
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2.1
48
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202
58
7
0
33
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12
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16
19
33
1.94
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2
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90
34
3
2
59
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123619223--123619363
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2
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2
100
0
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0
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20
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1.98
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11.5
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277
23
24
21
31
1.98
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178
7.2
178
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1745
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21
18
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1.97
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16
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60
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29
1.28
123631126--123631169
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2.0
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2.0
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0
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Copy
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Percent
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T
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Period
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0
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4
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1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
46
1.09

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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