Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  93  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22367955--22368038
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3.2
26
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3
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3
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5
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0
0
30
0.88
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2.2
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31
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50
2.0
50
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0
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2.2
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2
152
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5
2
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1.36
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21
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19
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0
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21
2.0
21
90
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0
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20
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11.2
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76
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0
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3
12
0.74
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4.4
13
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10
55
81
1
5
12
0.94
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13
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16
52
78
7
0
14
0.95
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19
2.8
20
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77
5
0
16
0.94
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8.7
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13
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79
7
0
12
0.93
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134
2.2
134
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1
428
30
17
25
26
1.97
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89
5.1
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67
9
249
28
17
26
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1.98
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178
3.2
178
87
2
754
28
17
26
27
1.97
22397592--22398064
44
10.6
44
68
12
180
27
16
28
27
1.97
22397187--22397834
312
2.1
312
87
2
928
29
16
26
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22397770--22398183
223
1.9
222
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1
650
27
17
28
27
1.98
22397985--22398101
44
2.6
44
82
4
119
29
16
26
28
1.97
22398165--22398460
45
6.6
45
71
7
197
29
19
22
27
1.98
22398248--22398460
91
2.4
90
82
6
236
30
19
23
26
1.98
22399916--22399968
25
2.1
25
100
0
106
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3
56
1.54
22400302--22400337
16
2.3
16
90
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56
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5
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2
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2
94
0
63
47
0
2
50
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41
17
17
22
1.90
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17
1.9
18
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52
2
29
0
67
1.05
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20
2.2
19
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12
59
57
4
0
38
1.20
22410202--22410249
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2.0
23
84
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75
0
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1.04
22422285--22422313
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2.3
13
94
5
51
48
13
17
20
1.81
22422288--22422403
45
2.6
45
88
0
160
40
15
18
25
1.90
22422793--22422824
16
1.9
17
93
6
57
59
9
0
31
1.29
22428415--22428445
2
15.5
2
93
0
53
48
3
0
48
1.17
22428782--22428832
21
2.4
21
81
15
61
23
5
9
60
1.50
22430414--22430446
17
1.9
17
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0
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0
0
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95
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51
76
0
0
23
0.78
22430414--22430446
9
3.8
9
88
8
50
72
0
0
27
0.85
22443455--22443484
2
15.0
2
92
0
51
46
0
3
50
1.18
22444418--22444547
43
3.0
44
82
4
149
30
26
17
25
1.97
22453081--22453129
23
2.0
26
88
11
77
61
0
0
38
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22457746--22457937
78
2.5
77
82
5
215
20
21
26
30
1.98
22457746--22457937
38
4.9
39
81
3
208
20
21
26
30
1.98
22458995--22459066
20
3.6
20
78
10
76
50
16
20
12
1.78
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18
2.0
18
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22
19
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1.97
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2.0
61
98
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239
54
16
12
16
1.72
22484218--22484611
27
14.6
27
85
3
452
27
21
9
41
1.83
22484563--22484622
27
2.2
27
81
0
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1.81
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1.9
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86
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11
5.5
11
71
16
57
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10
19
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1.86
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20
3.0
20
95
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113
36
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19
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1.85
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200
28
21
22
27
1.99
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3.0
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198
28
21
22
27
1.99
22486052--22486195
71
2.0
72
87
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211
29
21
22
27
1.99
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2.1
31
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25
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0
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0
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22
16
27
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9
5.9
9
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15
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8
21
35
1.84
22508563--22508625
20
3.2
20
95
0
117
36
12
19
31
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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20
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2.1
31
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23
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209
2.6
210
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2
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12
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1.89
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5.3
105
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1.89
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100
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21
2.4
21
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3
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51
12
12
24
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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54
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14
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36
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0
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51
1
22
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22630505--22630614
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2.8
28
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19
7
12
59
1.57

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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