Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  385  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111528389--111528455
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2.2
31
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0
0
50
1.00
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0
0
50
1.00
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3.2
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20
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0
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46
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2
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0
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0
0
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0
0
58
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58
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2.0
112
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2.0
54
94
0
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1.96
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15
25
1.94
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2.1
21
100
0
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20
9
29
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
1.94
111595186--111595235
24
2.1
24
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0
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32
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26
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45
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0
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0
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5
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51
0
17
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79
17
18
25
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2.3
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40
0
18
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51
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24
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2.3
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2.2
20
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0
35
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48
0
48
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100
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102
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0
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111612661--111612758
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2.8
35
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110
14
4
7
74
1.18
111612667--111612758
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59
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16
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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365
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2.1
18
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45
5
32
16
1.70
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47
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163
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20
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1.68
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2.4
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42
5
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1.94
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325
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25
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1.95
111648855--111649074
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3.8
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316
29
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0
0
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16
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20
1.93
111694876--111694918
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2.4
18
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0
50
9
11
6
72
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111694879--111694908
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2.1
14
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0
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10
6
6
76
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34
1.9
37
85
8
99
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17
0
40
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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28
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0
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20
21
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27
1.98
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28
1.98
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1.98
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0
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1.02
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28
1.99
111752907--111753119
48
4.6
45
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10
207
23
27
19
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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1.34
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174
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0
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54
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4
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1.40
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2.2
22
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1.29
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0
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1.98
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1.93
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273
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0
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13
25
28
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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