Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  58  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14037063--14037172
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26
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0
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26
4.2
26
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2
166
33
4
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37
1.76
14044121--14044229
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2.1
52
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1
175
33
4
23
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29
21
20
1.98
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29
21
20
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14065805--14065976
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
14065798--14065973
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
14073372--14073543
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
14073365--14073540
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
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2.2
125
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18
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2.5
13
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111
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0
2
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14084588--14084638
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17
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0
1
35
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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1
1
33
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0
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9
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21
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2.2
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10
79
48
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10
22
1.78
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132
2.1
129
79
12
311
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20
28
1.96
14103462--14103706
131
1.9
130
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42
0
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1.31
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82
57
1
0
40
1.09
14107736--14108005
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28.6
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2
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1.28
14110630--14110682
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2.1
26
85
3
72
50
11
0
37
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14111209--14111293
19
4.5
19
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10
75
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2
4
28
1.26
14111250--14111298
20
2.4
21
80
13
57
59
4
6
30
1.41
14111209--14111293
9
9.0
9
70
14
55
64
2
4
28
1.26
14118949--14119011
13
4.8
13
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7
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1
9
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1.46
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25
1.98
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2.0
27
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24
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3.0
32
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2.4
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50
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2.8
27
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91
31
11
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1.89
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2.8
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83
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32
9
21
36
1.86
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2.8
32
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13
24
32
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11
3.9
11
84
3
50
45
7
23
23
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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133
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1.83
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1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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1.96
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19
21
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.97
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1.97
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1.97
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1
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21
25
19
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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