Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  424  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122661401--122661454
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122673050--122673103
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2
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46
4.7
46
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1
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14
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122695290--122695731
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562
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23
15
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1.92
122695290--122695731
130
3.3
132
85
8
537
23
23
15
38
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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176
2.3
176
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23
23
15
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1
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2.2
21
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0
0
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0
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0
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0
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26
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1.83
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2.5
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7
64
39
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2
58
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122724670--122724707
17
2.2
17
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0
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0
0.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122725458--122725500
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122725458--122725502
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2.9
16
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0
71
0
0.87
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0
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82
10
108
33
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1
57
1.35
122732214--122732277
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2.8
23
82
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71
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3
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1.33
122732251--122732312
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5.2
12
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11
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0
0
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29
0
0
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4.6
12
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9
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5
5
52
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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1.9
207
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1.93
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3.8
138
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20
20
39
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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18
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1.97
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2.0
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17
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1.94
122831688--122832032
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2.3
144
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1.92
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1.94
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2.0
121
94
0
417
34
18
15
30
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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72
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1.9
347
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0
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1.91
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267
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1.94
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1.9
54
85
9
144
37
19
15
27
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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