Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  77  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18288030--18288054
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108
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2
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18
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15
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2
60
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2.0
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0
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18
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0
2
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2.0
60
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15
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30
14
0
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14
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28
15
0
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1.40
18361091--18361128
16
2.5
15
88
12
60
81
2
0
15
0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18364290--18364338
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19
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53
0
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42
1.20
18364255--18364318
26
2.4
27
77
15
71
59
1
3
35
1.23
18364493--18364549
20
2.9
20
79
12
64
29
7
3
59
1.40
18364477--18364549
23
3.5
23
75
21
70
28
6
5
58
1.46
18364492--18364655
19
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20
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16
66
31
4
2
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1.30
18364487--18364685
9
21.2
9
66
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5
2
60
1.30
18364555--18364683
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3
1
60
1.24
18364576--18364676
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1.28
18365461--18365513
16
3.2
16
76
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54
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3
3
28
1.28
18368985--18369019
16
2.2
16
94
0
61
31
5
28
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1.81
18377583--18377622
18
2.2
18
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0
62
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0
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0
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10
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2.0
22
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11
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1.57
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15
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0
58
34
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1.29
18385939--18386030
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2.0
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1.77
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17
2.0
17
100
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17
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1.85
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2.1
41
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136
37
17
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38
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2.4
19
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56
60
2
0
37
1.09
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3.4
16
89
0
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37
5
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29
1.80
18399649--18399736
44
2.0
44
84
4
113
32
4
22
39
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18399906--18399940
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1.9
18
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0
61
60
0
2
37
1.12
18401246--18401286
18
2.3
18
87
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57
51
2
2
43
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17
2.5
17
88
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57
19
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45
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1.63
18404117--18404152
12
3.0
12
87
0
54
25
27
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41
1.77
18404125--18404156
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1.9
17
93
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57
25
28
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40
1.79
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16
22
36
1.94
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462
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22
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1.96
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19
25
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1.9
14
100
0
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14
14
7
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1.51
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2.4
14
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20
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55
1.62
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75
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166
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1.97
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19
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79
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74
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2
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29
17
21
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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18
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1.94
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121
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20
19
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.94
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1.94
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17
378
35
18
17
29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18453479--18453619
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1.93
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19
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1.97
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19
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1.96
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19
19
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1.96
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326
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8
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32
21
18
27
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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