Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  389  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112738619--112738819
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1
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3.6
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1
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1.54
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2.5
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0
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1
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1.53
112738696--112738819
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3
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23
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2.0
38
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0
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21
26
18
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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22
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1.96
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3.8
40
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27
24
1.99
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17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
112788285--112788434
40
3.8
39
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153
26
22
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1.99
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1
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0
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2.3
24
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2
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2.4
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88
0
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32
13
41
11
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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50
57
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24
18
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1.96
112833171--112833380
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23
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2.2
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2
332
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17
25
1.97
112901286--112901511
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2.2
101
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5
0
28
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1.9
31
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6
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33
16
33
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.92
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1.03
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1.9
34
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54
0
6
39
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5.2
40
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2
305
25
24
28
21
1.99
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2
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1.99
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113022964--113023272
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100
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0
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1.00
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10
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2
0
57
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0.76
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1.98
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1.98
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23
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1.94
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4.2
27
82
3
120
17
23
22
36
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444