Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  320  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92405025--92405343
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1.99
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2.3
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27
27
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1.99
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2.0
117
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275
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1.99
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2.5
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29
24
18
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2.3
209
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26
18
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1.98
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2.6
279
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25
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26
1.98
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18
2.7
18
80
0
60
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0
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63
0
2
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10
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3
0
63
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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7
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7
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1.23
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24
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23
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10
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0
0
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20
2.0
20
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2
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13
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23
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285
22
24
28
24
1.99
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2.1
19
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7
2
17
1.19
92468152--92468337
17
11.7
16
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1
1
32
1.10
92468161--92468337
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20
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1
32
1.08
92468150--92468337
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1
32
1.10
92468156--92468337
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1
32
1.11
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72
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62
1
1
34
1.10
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4.5
42
77
17
153
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1
1
32
1.10
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7
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1
33
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1
32
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84
81
10
230
62
1
1
34
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92468164--92468422
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26
14
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1.95
92469845--92470611
271
2.8
269
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1090
28
26
14
30
1.95
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1.9
25
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25
14
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1.94
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35
1.84
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20
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20
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178
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44
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5
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14
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33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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32
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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61
1.15

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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