Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  71  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16891328--16891408
22
3.6
22
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25
62
24
20
12
41
1.87
16891375--16891439
33
2.0
33
100
0
130
27
21
10
40
1.87
16891329--16891485
79
2.0
79
100
0
314
25
21
12
40
1.88
16891283--16891531
125
2.0
125
99
0
489
24
22
12
40
1.88
16891237--16891571
171
2.0
171
97
0
634
24
22
12
40
1.89
16891408--16891571
46
3.6
46
100
0
328
24
21
12
41
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16893711--16893762
11
4.7
11
76
9
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63
3
0
32
1.12
16896593--16896918
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23
14
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16896840--16896920
22
3.6
22
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25
62
24
20
12
41
1.87
16896887--16896951
33
2.0
33
100
0
130
27
21
10
40
1.87
16896841--16896997
79
2.0
79
100
0
314
25
21
12
40
1.88
16896795--16897043
125
2.0
125
99
0
489
24
22
12
40
1.88
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171
2.0
171
97
0
634
24
22
12
40
1.89
16896920--16897083
46
3.6
46
100
0
328
24
21
12
41
1.87
16899221--16899272
11
4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
16902450--16902474
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100
0
50
40
16
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16
2.7
16
85
14
52
39
12
0
48
1.41
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38
2.9
38
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211
44
5
12
37
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2.2
18
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0
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52
10
17
20
1.72
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116
2.0
116
94
0
404
25
12
25
36
1.91
16916656--16916684
14
2.1
14
100
0
58
41
17
13
27
1.87
16917575--16917617
21
2.1
21
86
4
61
48
9
2
39
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16920359--16920628
116
2.3
116
88
0
396
35
18
21
24
1.95
16920557--16920641
40
2.1
40
88
0
125
34
17
24
23
1.96
16921658--16921887
80
2.8
81
85
3
284
39
13
22
25
1.90
16921686--16921887
83
2.5
80
83
4
244
36
12
24
26
1.91
16924108--16924161
27
2.0
27
100
0
108
33
14
29
22
1.94
16924112--16924170
27
2.2
27
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3
84
35
15
27
22
1.94
16926649--16926681
14
2.4
14
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5
59
33
0
6
60
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4.7
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583
38
6
3
51
1.46
16926668--16927029
99
3.7
99
97
1
685
38
6
4
50
1.48
16926668--16927029
195
1.8
198
97
1
685
38
6
4
50
1.48
16927134--16927243
34
3.4
32
75
14
109
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2
39
1.61
16927134--16927297
9
18.2
9
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72
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15
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37
1.63
16927155--16927255
16
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16
74
13
91
43
16
2
36
1.64
16927430--16927498
9
7.9
9
79
9
63
47
17
0
34
1.48
16927430--16927464
18
1.9
18
100
0
70
45
17
0
37
1.48
16927423--16927497
34
2.2
34
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98
49
16
0
34
1.46
16932975--16933024
15
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26
20
54
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5
100
0
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20
0
0
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13
19
25
41
1.88
16937734--16937765
13
2.5
13
94
0
55
0
12
46
40
1.42
16946566--16946603
20
2.0
20
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60
57
10
2
28
1.45
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3
16.0
3
100
0
96
66
0
0
33
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16948605--16948802
54
3.7
54
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0
344
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19
14
29
1.92
16948854--16949563
54
13.0
54
90
3
1109
38
17
13
29
1.89
16948519--16949330
249
3.2
249
83
7
902
37
18
14
29
1.91
16948854--16949563
109
6.5
109
92
1
1151
38
17
13
29
1.89
16948854--16949563
219
3.3
219
92
2
1164
38
17
13
29
1.89
16949543--16949576
13
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14
85
9
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64
5
8
20
1.43
16949557--16950691
74
15.0
74
85
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29
21
17
30
1.96
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2.7
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1094
29
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1.97
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1.9
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1342
29
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17
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1.97
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0
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0
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3
6
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16972163--16972205
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2.1
32
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15
79
47
1
0
51
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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20
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1.62
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17001285--17001509
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1.96
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2.1
46
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13
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9
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1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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8
0
8
0.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17049698--17049746
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2.1
24
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24
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0
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1.84
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28
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23
23
31
1.98
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1.97
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1.99
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136
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0
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24
18
25
31
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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