Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  62  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14818526--14818614
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43
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12
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4
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15
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2
0
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1.18
14818555--14818659
37
2.8
37
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13
97
36
2
0
60
1.18
14818557--14818712
7
22.4
7
68
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3
2
58
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2.1
26
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0
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7
24
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136
2.1
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2.3
26
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22
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14834844--14834910
31
2.2
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83
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20
25
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115
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2.0
13
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23
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15
4
5
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1.16
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24
2.7
26
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90
15
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0
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18
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65
16
0
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72
1.12
14844443--14844504
6
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6
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54
16
0
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1.12
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13
100
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2
33
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14860980--14861113
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51
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2
33
1.70
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12
2.6
12
100
0
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12
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25
9
1.70
14869152--14869287
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26
91
0
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23
2
33
1.70
14874104--14874134
12
2.6
12
100
0
62
12
51
25
9
1.70
14877315--14877449
26
5.2
26
91
1
227
40
23
2
33
1.70
14878687--14878745
10
5.7
10
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2.8
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24
37
1.79
14880552--14880657
51
2.1
51
89
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160
32
5
24
37
1.79
14882142--14882194
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2.0
26
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2.0
144
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15
26
28
1.96
14895573--14895662
44
2.2
40
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5
1
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2.0
101
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21
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13
2
2
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2
2
80
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24
100
0
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12
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10
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14919589--14919613
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8.3
3
100
0
50
68
0
0
32
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14926593--14926636
17
2.4
19
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1.10
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1.9
18
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61
41
0
0
58
0.98
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2.1
19
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53
35
2
0
61
1.10
14926756--14926798
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37
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1.10
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0
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0
0
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20
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28
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0
5
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64
5.7
64
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7
552
39
10
3
46
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14949736--14949825
29
3.2
29
61
12
69
40
11
4
44
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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8
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39
10
3
46
1.55
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56
4.1
56
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13
291
40
10
3
45
1.57
14949787--14949971
61
3.0
62
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4
329
41
10
2
46
1.50
14949618--14949953
181
1.8
181
93
2
584
39
11
3
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1.57
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21
0
31
1.57
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1
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1.60
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2.0
57
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0
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0
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17
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0
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19
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1.10
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2
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1.12
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1.93
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0
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0
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38
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0
121
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21
9
27
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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5
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31
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0
0
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1.21
15001879--15001953
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35
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2
0
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1.07
15001884--15001953
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2
0
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1.98
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195
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1.72
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1.71
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137
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0
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13
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1.72
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0
0
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3
100
0
64
31
0
0
68
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15022899--15022977
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2.8
27
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0
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2.7
207
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0
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0
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13
0
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1.40
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21
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2
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1.28
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24
2.5
25
78
7
72
42
1
8
47
1.43

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444