Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  11  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3220533--3220766
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2
0
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0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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14
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16
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21
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0
53
27
0
5
67
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
18
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1
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2.4
19
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0
66
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
2.0
30
83
3
77
43
1
0
55
1.10
3417032--3417109
29
2.7
29
78
9
77
41
3
0
55
1.18
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20
2.0
20
82
8
50
51
0
11
37
1.39
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2
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2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
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5
5.2
5
100
0
52
38
19
19
23
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20
2.0
19
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43
15
7
33
1.75
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10
3.9
10
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12
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23
0
0
76
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2.0
22
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27
0
0
72
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37
12
13
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1.83
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38
2.1
38
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4
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2.0
23
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24
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20
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33
0
6
60
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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70
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0
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15
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0
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2.0
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0
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2.0
116
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21
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2.1
30
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0
117
26
3
12
57
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3550884--3550917
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0
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0
0
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0
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