Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  92  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22070001--22070087
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1
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2.5
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99
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1.9
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48
100
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0
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2.3
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17.5
2
100
0
70
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0
0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
18
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0
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2
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2.1
16
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0
0
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43
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2.1
19
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33
5
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30
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17
25
1.96
22131765--22131804
21
1.9
21
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25
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2.4
24
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12
7
14
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13
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0
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17
14
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1.77
22159595--22159639
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0
0
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100
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0
0
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17
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3
26
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1.26
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2.0
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19
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2.0
24
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0
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0
100
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0
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0
0
50
1.00
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20
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23
2.1
23
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7
62
43
4
2
50
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22191584--22191672
19
4.8
19
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37
14
10
38
1.80
22191596--22191666
35
2.0
36
97
2
135
36
14
11
38
1.81
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2
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0
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0
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1.00
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0
0
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22208056--22208088
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2.9
11
95
4
57
27
0
0
72
0.85
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1.9
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159
28
21
26
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1.99
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2.0
144
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16
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3
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1.06
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17
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6
6.5
6
90
0
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15
12
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1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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146
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18
11
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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10
0
38
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.96
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38
22
22
15
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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